236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3925 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  100 
 
 		 248 aa  494  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  63.45 
 
 		 249 aa  315  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  62.9 
 
 		 248 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  63.31 
 
 		 249 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  61.45 
 
 		 249 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  60.89 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  63.31 
 
 		 249 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  62.9 
 
 		 249 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  62.9 
 
 		 249 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  61.69 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  58.57 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  35.83 
 
 		 279 aa  125  9e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  36.07 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  36.41 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  32.68 
 
 		 266 aa  101  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  38.22 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.6 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3997  Baf family transcriptional activator  31.6 
 
 		 246 aa  96.3  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000868707  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  32.22 
 
 		 293 aa  95.1  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  33.06 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  32.79 
 
 		 256 aa  92.8  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  31.8 
 
 		 293 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  32.6 
 
 		 245 aa  85.9  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  29.8 
 
 		 242 aa  85.9  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  29.21 
 
 		 295 aa  85.1  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  27.06 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.69 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  33.89 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  32 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  30.45 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  31.3 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  35.9 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  31.39 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  36.09 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.6 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  29.34 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  30.22 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  28.96 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  28.96 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  28.96 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  28.96 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  28.96 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  29.39 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  33.85 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  33.85 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  35.11 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  35.33 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  30.06 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  29.44 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  29.89 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  31.55 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  34.03 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  31.1 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  30 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  28.2 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0327  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.95 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  29.34 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  29.34 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.72 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  34.15 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  29.34 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  28.57 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  30.08 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  28.35 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  28.4 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  26.48 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  35.1 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  29.07 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.52 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  33.94 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  33.94 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  29.08 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.54 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35530  pantothenate kinase  34.15 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0754114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  24.71 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  32.64 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1801  pantothenate kinase  35.15 
 
 		 295 aa  62  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  27.67 
 
 		 255 aa  62  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4483  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.76 
 
 		 262 aa  62  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8379  pantothenate kinase  32.53 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  26.25 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  30.37 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  29.57 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  30.37 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.06 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4379  pantothenate kinase  31.29 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.174078 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4446  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.5 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  28.39 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.1 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  26 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02843  pantothenate kinase  35.09 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  29.63 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  26.7 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  30.61 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  33.13 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  28.37 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  25.67 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  28.68 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>