168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1230 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  100 
 
 		 221 aa  438  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  98.19 
 
 		 242 aa  431  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  63.78 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02843  pantothenate kinase  63.13 
 
 		 242 aa  221  7e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  36.49 
 
 		 269 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  34.64 
 
 		 270 aa  85.1  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  42.07 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  34.91 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  32.26 
 
 		 270 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  31.94 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  32.73 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  32.73 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  32.73 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  32.73 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  32.73 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  30.97 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  33.91 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  32.73 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  32.58 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  31.09 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  30.73 
 
 		 293 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  33.85 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  30.73 
 
 		 293 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  32.14 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  40.36 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  30.14 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  40.77 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  29.05 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  29.35 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  31.89 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  31.89 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  28.89 
 
 		 244 aa  72  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  31.15 
 
 		 266 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  32.07 
 
 		 262 aa  71.6  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  32.04 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  33.53 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  31.35 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  31.15 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  31.15 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  30.85 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  30.85 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  30.41 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  31.12 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  28.7 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  33.74 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  35 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  27.7 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  34.29 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  30.06 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  31.36 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  37.61 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  30.46 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  28.83 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  30.18 
 
 		 254 aa  62  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.41 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  42.48 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  30.77 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  27.81 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  27.66 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  30.18 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  30 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  29.19 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  32.26 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  28.99 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  31.46 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23250  transcriptional activator, putative, Baf family  27.86 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  38.84 
 
 		 266 aa  57  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  28.34 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  29.34 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  33.14 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  36.7 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  33.15 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  34.17 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  30 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  35 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.95 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  34.01 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  41.33 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.62 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.28 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  28.65 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  33.09 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0613  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.33 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0452  transcriptional activator, putative, Baf family  29.33 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.54 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1518  pantothenate kinase  32 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  33.93 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1408  pantothenate kinase  41.33 
 
 		 270 aa  48.9  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3997  Baf family transcriptional activator  30.28 
 
 		 246 aa  48.9  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000868707  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  23.4 
 
 		 264 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  23.81 
 
 		 256 aa  48.9  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1093  putative transcriptional activator, Baf family  25.53 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.040353  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.09 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4983  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.57 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442209  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  28.46 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  35.62 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  31.1 
 
 		 256 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  29.88 
 
 		 256 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>