172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3997 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3997  Baf family transcriptional activator  100 
 
 		 246 aa  511  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000868707  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.74 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  32.51 
 
 		 249 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  31.56 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  32.1 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  29.3 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  32.1 
 
 		 249 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  30.99 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  31.84 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  31.41 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  32.52 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  30.65 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  28.4 
 
 		 248 aa  85.1  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  30.73 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  30.12 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  29.8 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  29.47 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  31.43 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  34.05 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  31.28 
 
 		 244 aa  81.6  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  29.29 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  29.27 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  30.82 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  31.03 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  30.49 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  28.81 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  30.81 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  29.41 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.13 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  28.1 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  28.57 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  27.41 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1765  pantothenate kinase  27.02 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  42.59 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  27.87 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  34.07 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  29.34 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.24 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  31.43 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  29.45 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  24.07 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  31.15 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1772  pantothenate kinase  24.6 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1367  pantothenate kinase  33.87 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0238  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.34 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  34.68 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  29.1 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.27 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  26.19 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  26.19 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  26.19 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  26.19 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  26.19 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  25.79 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0958  pantothenate kinase  30.82 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1093  putative transcriptional activator, Baf family  26.37 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.040353  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.25 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.39 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  24.62 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.94 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  28.76 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.2 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  27.73 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  30.46 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  28.4 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  27.98 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1218  pantothenate kinase  26.92 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0258135  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  28.4 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2715  putative transcriptional activator, Baf family  31.67 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8379  pantothenate kinase  29.03 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  28.38 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23250  transcriptional activator, putative, Baf family  32.8 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  25.81 
 
 		 262 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  25.09 
 
 		 270 aa  52  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1408  pantothenate kinase  30.67 
 
 		 270 aa  52  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  31.61 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  25.57 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3221  pantothenate kinase  30.67 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  30.26 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0452  pantothenate kinase  28.29 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  28.23 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0146  pantothenate kinase  27.68 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  27.27 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  27.27 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  25.4 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  25.39 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1265  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.3 
 
 		 262 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4446  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.98 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  29.19 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  27.11 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  27.01 
 
 		 256 aa  49.3  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4483  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.39 
 
 		 262 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  27.11 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  23.61 
 
 		 257 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.755587 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2217  pantothenate kinase  25 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  30.28 
 
 		 221 aa  49.3  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 255 aa  48.9  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  25.81 
 
 		 266 aa  48.9  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.06 
 
 		 257 aa  48.5  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>