235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1765 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1765  pantothenate kinase  100 
 
 
272 aa  548  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  53.64 
 
 
268 aa  271  9e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  51.69 
 
 
266 aa  264  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1408  pantothenate kinase  50.39 
 
 
270 aa  252  6e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1218  pantothenate kinase  46.18 
 
 
266 aa  231  7.000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0258135  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1518  pantothenate kinase  42.91 
 
 
260 aa  224  9e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0958  pantothenate kinase  41.73 
 
 
260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  29.53 
 
 
243 aa  124  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.39 
 
 
252 aa  124  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  30.8 
 
 
258 aa  122  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1477  pantothenate kinase  34.23 
 
 
255 aa  122  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148615  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  29.62 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.38 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  29.55 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.33 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  30.04 
 
 
263 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0073  pantothenate kinase  28.57 
 
 
262 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0077  pantothenate kinase  28.57 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.02884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0064  pantothenate kinase  28.57 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0065  pantothenate kinase  28.57 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0061  pantothenate kinase  28.57 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0061  pantothenate kinase  28.57 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0065  pantothenate kinase  28.57 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0074  pantothenate kinase  28.57 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.335209 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.6 
 
 
254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  30.29 
 
 
274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0061  pantothenate kinase  27.8 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  31.56 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  29.62 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.3 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1724  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.08 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.345789  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  28.57 
 
 
256 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5243  pantothenate kinase  27.8 
 
 
262 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.141011 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  32.03 
 
 
256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  28.17 
 
 
244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  32.03 
 
 
256 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4446  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.62 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0063  pantothenate kinase  29.5 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  30.15 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0544  pantothenate kinase  28.9 
 
 
262 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0061  pantothenate kinase  27.2 
 
 
262 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  27.86 
 
 
254 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  29.69 
 
 
240 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  29.77 
 
 
255 aa  106  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4483  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.49 
 
 
262 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0065  pantothenate kinase  28.19 
 
 
258 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000107258  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  32.08 
 
 
264 aa  106  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  31.47 
 
 
266 aa  106  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  28.46 
 
 
255 aa  105  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  27.86 
 
 
254 aa  105  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1093  putative transcriptional activator, Baf family  29.65 
 
 
248 aa  105  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.040353  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2784  pantothenate kinase  27.1 
 
 
259 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2470  pantothenate kinase  27.1 
 
 
259 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  28.08 
 
 
255 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0136  pantothenate kinase  28.99 
 
 
255 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000027573  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0146  pantothenate kinase  28.52 
 
 
254 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  28.63 
 
 
254 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  28.85 
 
 
255 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  29.64 
 
 
261 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  31.35 
 
 
255 aa  102  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.08 
 
 
257 aa  102  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  28.46 
 
 
255 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00680  pantothenate kinase  27 
 
 
257 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1749  pantothenate kinase  30.95 
 
 
266 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0463672 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4983  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.97 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442209  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8379  pantothenate kinase  28.51 
 
 
262 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2186  Baf family transcriptional activator  30.45 
 
 
255 aa  99.4  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  31.15 
 
 
257 aa  99  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3611  Baf family transcriptional activator  30.4 
 
 
264 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  30.56 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  26.82 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.8 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  30.15 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0424  Baf family transcriptional activator  25.38 
 
 
255 aa  95.5  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00396752  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  28.63 
 
 
256 aa  95.1  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1772  pantothenate kinase  31.1 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2882  pantothenate kinase  27.31 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23250  transcriptional activator, putative, Baf family  27.38 
 
 
256 aa  94  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0113  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.08 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.164132 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1296  Baf family transcriptional activator  28.57 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9156  pantothenate kinase  27.2 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166595  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1868  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.92 
 
 
254 aa  93.2  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0248735  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02240  transcriptional activator, putative, Baf family  31.3 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0238  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.5 
 
 
260 aa  92.8  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  28.46 
 
 
252 aa  92.4  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0452  pantothenate kinase  29.53 
 
 
275 aa  92.4  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  26.89 
 
 
257 aa  92  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  26.89 
 
 
257 aa  92  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  27.27 
 
 
257 aa  92  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.755587 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  25.81 
 
 
254 aa  91.7  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3221  pantothenate kinase  32.22 
 
 
272 aa  91.3  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.5 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0081  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.44 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  31.15 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  34.86 
 
 
254 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  27.86 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  34.86 
 
 
254 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  34.86 
 
 
254 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  27.31 
 
 
259 aa  89.7  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5362  pantothenate kinase  35.37 
 
 
271 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331999  normal  0.0497904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>