231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0238 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0238  putative transcriptional acitvator, Baf family  100 
 
 
260 aa  521  1e-147  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2715  putative transcriptional activator, Baf family  55.51 
 
 
255 aa  279  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1367  pantothenate kinase  39 
 
 
247 aa  153  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  37.55 
 
 
255 aa  151  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  38.82 
 
 
252 aa  151  8.999999999999999e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  36.33 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  35.8 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3000  pantothenate kinase  34.35 
 
 
260 aa  139  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  34.24 
 
 
256 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  35.02 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  34.62 
 
 
269 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  33.87 
 
 
251 aa  139  6e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  34.11 
 
 
255 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  33.6 
 
 
246 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  35.23 
 
 
263 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0395  pantothenate kinase  38.36 
 
 
258 aa  137  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.286209  hitchhiker  0.000163208 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  34.11 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  38.1 
 
 
256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  38.1 
 
 
256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  35.47 
 
 
254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0160  pantothenate kinase  37.11 
 
 
258 aa  135  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144798  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0064  pantothenate kinase  33.33 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0065  pantothenate kinase  33.33 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0061  pantothenate kinase  33.33 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0061  pantothenate kinase  33.33 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0074  pantothenate kinase  33.33 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.335209 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5243  pantothenate kinase  33.76 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.141011 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0065  pantothenate kinase  33.33 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0073  pantothenate kinase  33.33 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2784  pantothenate kinase  34.87 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2470  pantothenate kinase  34.87 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0077  pantothenate kinase  33.33 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.02884  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1477  pantothenate kinase  31.22 
 
 
255 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148615  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2186  Baf family transcriptional activator  33.33 
 
 
255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0061  pantothenate kinase  32.91 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  33.98 
 
 
256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0061  pantothenate kinase  33.33 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0063  pantothenate kinase  32.52 
 
 
258 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.48 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0065  pantothenate kinase  33.05 
 
 
258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000107258  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  33.2 
 
 
254 aa  132  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  35.22 
 
 
258 aa  132  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  33.19 
 
 
254 aa  132  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  33.19 
 
 
254 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  33.33 
 
 
254 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  34.19 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0146  pantothenate kinase  33.19 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2285  pantothenate kinase  32.68 
 
 
260 aa  129  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1294  pantothenate kinase  31.13 
 
 
261 aa  128  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00680  pantothenate kinase  33.2 
 
 
257 aa  128  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  32.07 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  31.64 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0424  Baf family transcriptional activator  33.98 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00396752  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  30.2 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3221  pantothenate kinase  31.64 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3611  Baf family transcriptional activator  32.05 
 
 
264 aa  126  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  32.5 
 
 
254 aa  126  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  33.6 
 
 
255 aa  125  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1772  pantothenate kinase  33.33 
 
 
255 aa  125  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  30.86 
 
 
259 aa  125  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0136  pantothenate kinase  33.59 
 
 
255 aa  125  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000027573  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  31.65 
 
 
263 aa  125  6e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  31.78 
 
 
257 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1063  pantothenate kinase  31.91 
 
 
255 aa  124  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.156837 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  30.27 
 
 
257 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.755587 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02240  transcriptional activator, putative, Baf family  29.73 
 
 
257 aa  123  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1331  pantothenate kinase  30.38 
 
 
256 aa  122  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181075  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  30.92 
 
 
257 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0544  pantothenate kinase  32.77 
 
 
262 aa  122  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  30.92 
 
 
257 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0113  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.56 
 
 
260 aa  122  7e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.164132 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1296  Baf family transcriptional activator  32.34 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  28.86 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0452  pantothenate kinase  33.19 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  29.55 
 
 
261 aa  118  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  34.89 
 
 
252 aa  118  7.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  31.76 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0762  pantothenate kinase  30.8 
 
 
260 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.24 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1220  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.77 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0920  pantothenate kinase  31.25 
 
 
256 aa  113  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1749  pantothenate kinase  27.06 
 
 
266 aa  112  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0463672 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  32.28 
 
 
254 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  32.28 
 
 
254 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0569  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.01 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.156963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  32.16 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1265  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.96 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4446  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.88 
 
 
261 aa  108  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1480  pantothenate kinase  30.31 
 
 
254 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0377381  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23250  transcriptional activator, putative, Baf family  30.74 
 
 
256 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6393  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.17 
 
 
260 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.33 
 
 
253 aa  106  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2229  pantothenate kinase  29.39 
 
 
259 aa  106  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0327  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.56 
 
 
261 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2660  pantothenate kinase  28.81 
 
 
262 aa  105  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0177  pantothenate kinase  30.42 
 
 
264 aa  105  9e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.676311  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1868  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.51 
 
 
254 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0248735  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  29.11 
 
 
256 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0941  pantothenate kinase  30.23 
 
 
256 aa  103  3e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0081  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.71 
 
 
255 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>