235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0549 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  100 
 
 
258 aa  525  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  59.38 
 
 
256 aa  328  6e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  60.78 
 
 
254 aa  328  7e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  60.78 
 
 
254 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  59.38 
 
 
255 aa  316  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  58.2 
 
 
255 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0065  pantothenate kinase  56.69 
 
 
258 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000107258  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  56.47 
 
 
254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5243  pantothenate kinase  54.72 
 
 
262 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.141011 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  56.08 
 
 
255 aa  302  4.0000000000000003e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0063  pantothenate kinase  55.25 
 
 
258 aa  301  9e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  56.08 
 
 
254 aa  301  9e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0064  pantothenate kinase  54.33 
 
 
262 aa  300  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0065  pantothenate kinase  54.33 
 
 
262 aa  300  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0061  pantothenate kinase  54.33 
 
 
262 aa  300  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0061  pantothenate kinase  54.33 
 
 
262 aa  300  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0061  pantothenate kinase  54.33 
 
 
262 aa  300  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0065  pantothenate kinase  54.33 
 
 
262 aa  300  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0077  pantothenate kinase  54.33 
 
 
262 aa  300  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.02884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0074  pantothenate kinase  54.33 
 
 
262 aa  300  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.335209 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0073  pantothenate kinase  54.33 
 
 
262 aa  300  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0061  pantothenate kinase  54.33 
 
 
262 aa  300  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  57.65 
 
 
255 aa  298  5e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  58.43 
 
 
254 aa  294  8e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  58.43 
 
 
254 aa  294  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1480  pantothenate kinase  58.04 
 
 
254 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0377381  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  58.43 
 
 
254 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  55.12 
 
 
255 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  55.51 
 
 
254 aa  291  5e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  56.86 
 
 
264 aa  292  5e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  53.91 
 
 
255 aa  288  6e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0146  pantothenate kinase  53.94 
 
 
254 aa  284  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  54.47 
 
 
269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  53.18 
 
 
274 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0160  pantothenate kinase  53.7 
 
 
258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  53.73 
 
 
256 aa  280  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4446  putative transcriptional acitvator, Baf family  51.56 
 
 
261 aa  275  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  52.57 
 
 
262 aa  275  7e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2784  pantothenate kinase  51.92 
 
 
259 aa  271  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2470  pantothenate kinase  51.92 
 
 
259 aa  271  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00680  pantothenate kinase  50.79 
 
 
257 aa  270  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  54 
 
 
255 aa  263  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1477  pantothenate kinase  50.19 
 
 
255 aa  260  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148615  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1868  putative transcriptional acitvator, Baf family  51.37 
 
 
254 aa  258  8e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0248735  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0544  pantothenate kinase  50.39 
 
 
262 aa  257  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2186  Baf family transcriptional activator  49.61 
 
 
255 aa  255  5e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  47.84 
 
 
254 aa  254  7e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3611  Baf family transcriptional activator  47.31 
 
 
264 aa  254  8e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  47.45 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0136  pantothenate kinase  50.2 
 
 
255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000027573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1296  Baf family transcriptional activator  48.83 
 
 
255 aa  248  6e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9156  pantothenate kinase  48.26 
 
 
260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166595  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4483  putative transcriptional acitvator, Baf family  47.49 
 
 
262 aa  240  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  45.88 
 
 
254 aa  239  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  48.25 
 
 
256 aa  239  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2882  pantothenate kinase  48.06 
 
 
258 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  45.67 
 
 
258 aa  234  7e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  45.35 
 
 
257 aa  234  9e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4983  putative transcriptional acitvator, Baf family  45.95 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442209  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  44.88 
 
 
263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0081  putative transcriptional acitvator, Baf family  45.31 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0424  Baf family transcriptional activator  47.47 
 
 
255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00396752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8379  pantothenate kinase  44.49 
 
 
262 aa  231  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  43.7 
 
 
263 aa  229  4e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  43.58 
 
 
253 aa  228  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3423  putative Baf family transcriptional acitvator  44.4 
 
 
260 aa  228  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.354519  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  45.28 
 
 
266 aa  226  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4379  pantothenate kinase  43.92 
 
 
250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.174078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0327  putative transcriptional acitvator, Baf family  43.4 
 
 
261 aa  222  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2285  pantothenate kinase  45.7 
 
 
260 aa  219  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1265  putative transcriptional acitvator, Baf family  42.25 
 
 
262 aa  218  7e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4278  Baf family transcriptional activator  45.88 
 
 
254 aa  216  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  42.75 
 
 
263 aa  215  5e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4713  Baf family transcriptional activator  46.27 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.073438  hitchhiker  0.000383315 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1063  pantothenate kinase  44.92 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.156837 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35530  pantothenate kinase  44.87 
 
 
268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0754114  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13632  pantothenate kinase  44.32 
 
 
272 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.3574e-61  normal  0.0267284 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0464  pantothenate kinase  43.41 
 
 
257 aa  208  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1426  pantothenate kinase  42.86 
 
 
270 aa  208  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  40.39 
 
 
259 aa  208  9e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5362  pantothenate kinase  42.91 
 
 
271 aa  207  9e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331999  normal  0.0497904 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  41.98 
 
 
264 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3000  pantothenate kinase  41.15 
 
 
260 aa  204  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4760  pantothenate kinase  42.8 
 
 
267 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4846  pantothenate kinase  42.8 
 
 
267 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209493  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5146  pantothenate kinase  42.8 
 
 
267 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0920  pantothenate kinase  43.58 
 
 
256 aa  202  4e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4005  transcriptional activator, Baf family  42.32 
 
 
266 aa  201  7e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  39.06 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0762  pantothenate kinase  42.97 
 
 
260 aa  199  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  41.25 
 
 
257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.755587 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1294  pantothenate kinase  40.77 
 
 
261 aa  198  7e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  40.62 
 
 
257 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  40.62 
 
 
257 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  41.8 
 
 
253 aa  194  9e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2229  pantothenate kinase  40.08 
 
 
259 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1331  pantothenate kinase  41.25 
 
 
256 aa  189  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181075  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0569  putative transcriptional acitvator, Baf family  39.78 
 
 
285 aa  186  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.156963  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1907  putative transcriptional acitvator, Baf family  37.4 
 
 
270 aa  186  4e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1220  putative transcriptional acitvator, Baf family  42.19 
 
 
255 aa  185  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>