227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1331 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1331  pantothenate kinase  100 
 
 		 256 aa  523  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181075  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  73.73 
 
 		 257 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0762  pantothenate kinase  78.04 
 
 		 260 aa  395  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  73.73 
 
 		 257 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  73.73 
 
 		 257 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.755587 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2229  pantothenate kinase  70.2 
 
 		 259 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1198  pantothenate kinase  67.84 
 
 		 259 aa  336  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  55.08 
 
 		 261 aa  280  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  51.18 
 
 		 259 aa  272  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  53.33 
 
 		 257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2285  pantothenate kinase  49.8 
 
 		 260 aa  251  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3000  pantothenate kinase  51.81 
 
 		 260 aa  246  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  48.58 
 
 		 266 aa  240  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1294  pantothenate kinase  46.9 
 
 		 261 aa  226  4e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  46.48 
 
 		 255 aa  224  8e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  43.75 
 
 		 255 aa  222  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  46.48 
 
 		 255 aa  221  8e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0063  pantothenate kinase  42.19 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  43.92 
 
 		 269 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 255 aa  215  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0064  pantothenate kinase  40.86 
 
 		 262 aa  215  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0065  pantothenate kinase  40.86 
 
 		 262 aa  215  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0061  pantothenate kinase  40.86 
 
 		 262 aa  215  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0061  pantothenate kinase  40.86 
 
 		 262 aa  215  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0065  pantothenate kinase  40.86 
 
 		 262 aa  215  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0074  pantothenate kinase  40.86 
 
 		 262 aa  215  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.335209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  43.98 
 
 		 274 aa  215  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0077  pantothenate kinase  40.86 
 
 		 262 aa  215  7e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.02884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0073  pantothenate kinase  40.86 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0061  pantothenate kinase  40.47 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5243  pantothenate kinase  40.86 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.141011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  45.88 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  44.71 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  44.71 
 
 		 254 aa  211  7e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  44.71 
 
 		 254 aa  211  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0065  pantothenate kinase  40.94 
 
 		 258 aa  210  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000107258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0061  pantothenate kinase  39.69 
 
 		 262 aa  208  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  43.36 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  45.49 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  42.75 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  43.92 
 
 		 264 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  42.75 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00680  pantothenate kinase  42.91 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  44.27 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  40 
 
 		 256 aa  201  9e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  41.34 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  41.73 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  39.3 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4446  putative transcriptional acitvator, Baf family  45.1 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2784  pantothenate kinase  38.7 
 
 		 259 aa  198  7.999999999999999e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2470  pantothenate kinase  38.7 
 
 		 259 aa  198  7.999999999999999e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 255 aa  198  9e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0136  pantothenate kinase  38.82 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000027573  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  41.73 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0160  pantothenate kinase  41.73 
 
 		 258 aa  195  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144798  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0544  pantothenate kinase  38.28 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0146  pantothenate kinase  41.34 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  41.34 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1480  pantothenate kinase  43.53 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0377381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1296  Baf family transcriptional activator  41.8 
 
 		 255 aa  191  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2186  Baf family transcriptional activator  42.02 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  41.96 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  42.35 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  41.25 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4483  putative transcriptional acitvator, Baf family  40.31 
 
 		 262 aa  188  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  40.85 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  41.18 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1265  putative transcriptional acitvator, Baf family  41.3 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1477  pantothenate kinase  41.25 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148615  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0081  putative transcriptional acitvator, Baf family  38.91 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8379  pantothenate kinase  38.61 
 
 		 262 aa  181  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9156  pantothenate kinase  40.31 
 
 		 260 aa  181  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  42.41 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3611  Baf family transcriptional activator  38.78 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0424  Baf family transcriptional activator  35.94 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00396752  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  40 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3423  putative Baf family transcriptional acitvator  41.04 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.354519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1868  putative transcriptional acitvator, Baf family  42.35 
 
 		 254 aa  178  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0248735  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0327  putative transcriptional acitvator, Baf family  39.08 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2882  pantothenate kinase  39.69 
 
 		 258 aa  175  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4379  pantothenate kinase  38.74 
 
 		 250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.174078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4713  Baf family transcriptional activator  40.32 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.073438  hitchhiker  0.000383315 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1063  pantothenate kinase  33.07 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.156837 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35530  pantothenate kinase  39.46 
 
 		 268 aa  172  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0754114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0920  pantothenate kinase  36.86 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4278  Baf family transcriptional activator  39.53 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.59 
 
 		 263 aa  168  6e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4983  putative transcriptional acitvator, Baf family  37.6 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442209  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  37.31 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.62 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  35.2 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5362  pantothenate kinase  36.74 
 
 		 271 aa  152  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331999  normal  0.0497904 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  35.2 
 
 		 256 aa  152  7e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2715  putative transcriptional activator, Baf family  36.65 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0464  pantothenate kinase  38.28 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  36.15 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0177  pantothenate kinase  32.28 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.676311  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4005  transcriptional activator, Baf family  38.02 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13632  pantothenate kinase  36.36 
 
 		 272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.3574e-61  normal  0.0267284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4760  pantothenate kinase  35.98 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>