239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1297 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  100 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  52.67 
 
 		 240 aa  236  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3272  pantothenate kinase  46.12 
 
 		 235 aa  207  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  35.57 
 
 		 243 aa  158  7e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  33.99 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  33.07 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  35.6 
 
 		 244 aa  148  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  36.43 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  37.84 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.32 
 
 		 257 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1765  pantothenate kinase  29.5 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.32 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  30.7 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0958  pantothenate kinase  32.02 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  29.18 
 
 		 256 aa  86.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  29.18 
 
 		 256 aa  86.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  35.4 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.85 
 
 		 254 aa  86.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.71 
 
 		 253 aa  85.5  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0452  transcriptional activator, putative, Baf family  32.7 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2285  pantothenate kinase  31.2 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0613  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.7 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  28.36 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1093  putative transcriptional activator, Baf family  30.57 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.040353  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2217  pantothenate kinase  36.36 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  28.06 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  28.19 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  38.75 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1218  pantothenate kinase  29.66 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0258135  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1408  pantothenate kinase  30.65 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3950  transcriptional activator, Baf family  30.43 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.151216  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  28.05 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0544  pantothenate kinase  28.24 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  26.99 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  27.98 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1868  putative transcriptional acitvator, Baf family  35.29 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0248735  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  35.67 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1518  pantothenate kinase  29.94 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  27.06 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  34.29 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0073  pantothenate kinase  30.91 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0113  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.33 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.164132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  29.32 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  26.82 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  27 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  25.91 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  31.79 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  33.12 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5243  pantothenate kinase  30.3 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.141011 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  26.82 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  28.7 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  33.13 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4022  putative transcriptional acitvator, Baf family  34.32 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147612 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0064  pantothenate kinase  30.3 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0065  pantothenate kinase  30.3 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0061  pantothenate kinase  30.3 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0061  pantothenate kinase  30.3 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0065  pantothenate kinase  30.3 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  28.09 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0074  pantothenate kinase  30.3 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.335209 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0077  pantothenate kinase  30.3 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.02884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  29.49 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  30.04 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0061  pantothenate kinase  31.52 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0065  pantothenate kinase  30.18 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000107258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3000  pantothenate kinase  33.77 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.42 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4983  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.84 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442209  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4483  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.88 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1294  pantothenate kinase  26.89 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1724  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.79 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.345789  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.81 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  27.59 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  27.91 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0061  pantothenate kinase  28.75 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  25.53 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  25.53 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  32.74 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.755587 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2997  pantothenate kinase  29.37 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2186  Baf family transcriptional activator  28.74 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2882  pantothenate kinase  28.77 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  28.74 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3123  pantothenate kinase  29.66 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9156  pantothenate kinase  27.72 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4170  pantothenate kinase  29.41 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0063  pantothenate kinase  29.7 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  26.69 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1331  pantothenate kinase  34.5 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181075  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  28.33 
 
 		 254 aa  72  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.28 
 
 		 254 aa  72  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0146  pantothenate kinase  26.62 
 
 		 254 aa  72  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2229  pantothenate kinase  31.36 
 
 		 259 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2660  pantothenate kinase  34.07 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4446  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.2 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  34.34 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  31.76 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  31.64 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  31.93 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1296  Baf family transcriptional activator  27.97 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>