218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3272 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3272  pantothenate kinase  100 
 
 		 235 aa  483  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  51.48 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  46.12 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  39.83 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  37.19 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  34.3 
 
 		 244 aa  149  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  36.89 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  30.58 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.03 
 
 		 257 aa  98.2  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  32.62 
 
 		 256 aa  95.5  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  32.62 
 
 		 256 aa  95.5  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.91 
 
 		 252 aa  90.9  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0958  pantothenate kinase  31.61 
 
 		 260 aa  88.2  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  32.72 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  37.59 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 255 aa  85.1  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0063  pantothenate kinase  29.02 
 
 		 258 aa  85.1  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0065  pantothenate kinase  29.3 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000107258  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  26.83 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  30.46 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5243  pantothenate kinase  29.18 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.141011 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0064  pantothenate kinase  29.18 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0065  pantothenate kinase  29.18 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0061  pantothenate kinase  29.18 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0061  pantothenate kinase  29.18 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0077  pantothenate kinase  29.18 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.02884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0074  pantothenate kinase  29.18 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.335209 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0065  pantothenate kinase  29.18 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0073  pantothenate kinase  28.76 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23250  transcriptional activator, putative, Baf family  32.93 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0061  pantothenate kinase  29.13 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0061  pantothenate kinase  29.18 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  31.1 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  31.1 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  31.1 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.97 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2997  pantothenate kinase  29.05 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1765  pantothenate kinase  26.41 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  27.2 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3123  pantothenate kinase  29.05 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  30 
 
 		 255 aa  78.2  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  26.34 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4022  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.47 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147612 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  29.64 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  28.21 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1518  pantothenate kinase  25.49 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.85 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  29 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  28.51 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  26.56 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  34.36 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  28.7 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0136  pantothenate kinase  27.31 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000027573  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  28.21 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1480  pantothenate kinase  27.06 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0377381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  32.1 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.755587 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3000  pantothenate kinase  26.77 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  26.09 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0544  pantothenate kinase  27.45 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  34.93 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0146  pantothenate kinase  28.51 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  26.96 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  26.88 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  26.34 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3950  transcriptional activator, Baf family  30.72 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.151216  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1367  pantothenate kinase  28.22 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1408  pantothenate kinase  28.66 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  28.74 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1294  pantothenate kinase  30.19 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1265  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.48 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  26.88 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1296  Baf family transcriptional activator  29.8 
 
 		 255 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  26.34 
 
 		 293 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  27.51 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1093  putative transcriptional activator, Baf family  29.82 
 
 		 248 aa  71.6  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.040353  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  29.02 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  27.39 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2186  Baf family transcriptional activator  29.53 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  26.5 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0578  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.56 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0613  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.15 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0452  transcriptional activator, putative, Baf family  30.15 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.93 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2217  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  31.48 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  28.91 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  28.4 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0452  pantothenate kinase  30.34 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  31.48 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  26.21 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  26.46 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  25.94 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1868  putative transcriptional acitvator, Baf family  24.32 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0248735  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  26.25 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  31.17 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4483  putative transcriptional acitvator, Baf family  24.54 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  26.15 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1331  pantothenate kinase  30.06 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181075  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1811  pantothenate kinase  35.56 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>