243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0613 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0613  putative transcriptional acitvator, Baf family  100 
 
 		 241 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0452  transcriptional activator, putative, Baf family  100 
 
 		 241 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  32.65 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  40.96 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1367  pantothenate kinase  28.93 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  31.82 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  28.92 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  33.81 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1220  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.47 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  27.24 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1772  pantothenate kinase  35.76 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  33.54 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0238  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.97 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  28.65 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  34.25 
 
 		 240 aa  85.5  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.7 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2715  putative transcriptional activator, Baf family  31.03 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1518  pantothenate kinase  35.95 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  33.19 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0958  pantothenate kinase  34.19 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.48 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  35.22 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  30.67 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1093  putative transcriptional activator, Baf family  33.11 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.040353  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1765  pantothenate kinase  31.21 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3950  transcriptional activator, Baf family  33.47 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.151216  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  34.16 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3123  pantothenate kinase  33.14 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2997  pantothenate kinase  33.14 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  36.18 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  36.36 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  34.46 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1724  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.49 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.345789  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  40.35 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1408  pantothenate kinase  33.77 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0113  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.28 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.164132 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0061  pantothenate kinase  26.09 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0061  pantothenate kinase  25.69 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0064  pantothenate kinase  25.69 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0065  pantothenate kinase  25.69 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0061  pantothenate kinase  25.69 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0061  pantothenate kinase  25.69 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0077  pantothenate kinase  25.69 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.02884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5243  pantothenate kinase  25.69 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.141011 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0065  pantothenate kinase  25.69 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.98 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  32.29 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0074  pantothenate kinase  25.69 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.335209 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  35.66 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  27.03 
 
 		 249 aa  72  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0073  pantothenate kinase  25.69 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  32.54 
 
 		 254 aa  72  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  25 
 
 		 252 aa  72  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.71 
 
 		 253 aa  71.6  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4379  pantothenate kinase  33.47 
 
 		 250 aa  71.6  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.174078 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2285  pantothenate kinase  36.72 
 
 		 260 aa  71.6  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1749  pantothenate kinase  29.18 
 
 		 266 aa  71.6  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0463672 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  36 
 
 		 263 aa  72  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  28.5 
 
 		 256 aa  71.6  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  34.81 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  28.11 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3272  pantothenate kinase  30.15 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2784  pantothenate kinase  25.86 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2470  pantothenate kinase  25.86 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0452  pantothenate kinase  28.29 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  34.78 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.77 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  35.17 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  29.46 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  31.28 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  35.48 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0081  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.8 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0569  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.81 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.156963  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  35.29 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  33.76 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  30.77 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1218  pantothenate kinase  36.44 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0258135  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1265  putative transcriptional acitvator, Baf family  35 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  33.09 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  26.43 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02240  transcriptional activator, putative, Baf family  30.94 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2229  pantothenate kinase  35.09 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6393  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.12 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3221  pantothenate kinase  33.09 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  28.85 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0464  pantothenate kinase  36.91 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  31.23 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0146  pantothenate kinase  31.36 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  31.47 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  28.68 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  28.68 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  28.68 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  28.68 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  28.68 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4005  transcriptional activator, Baf family  35.25 
 
 		 266 aa  65.1  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  28.68 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4483  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.9 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5362  pantothenate kinase  35.25 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331999  normal  0.0497904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>