230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0166 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  100 
 
 		 293 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  96.59 
 
 		 293 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  78.91 
 
 		 295 aa  431  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  52.65 
 
 		 275 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  52.69 
 
 		 277 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  40.96 
 
 		 262 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  41.94 
 
 		 259 aa  155  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  38.75 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  40.29 
 
 		 262 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  40.43 
 
 		 262 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  41.58 
 
 		 256 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  41.58 
 
 		 256 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  41.58 
 
 		 256 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  41.58 
 
 		 256 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  41.58 
 
 		 256 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  37.02 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  41.22 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  39.47 
 
 		 266 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  37.45 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  38.52 
 
 		 266 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  38.58 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  38.58 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  40.98 
 
 		 245 aa  126  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  35.38 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  37 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  34.91 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  34.91 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  35.25 
 
 		 284 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  35.74 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  34.31 
 
 		 254 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  34.91 
 
 		 255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  31.88 
 
 		 255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  33.82 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  36.2 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  34.88 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  31.77 
 
 		 255 aa  99.8  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  33.21 
 
 		 253 aa  99.4  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  35.32 
 
 		 270 aa  96.7  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  32.22 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  29.39 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2217  pantothenate kinase  35.16 
 
 		 263 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.11 
 
 		 269 aa  92.8  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  33.7 
 
 		 248 aa  92  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.1 
 
 		 255 aa  90.9  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  32.1 
 
 		 244 aa  89.7  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  37.04 
 
 		 254 aa  89.7  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  27.8 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  27.86 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  34.83 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  31.6 
 
 		 246 aa  85.9  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  35.8 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  30.96 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0958  pantothenate kinase  31.65 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3221  pantothenate kinase  29.77 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.06 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  35.5 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  27.11 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02843  pantothenate kinase  29.61 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  31.1 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  28.27 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  31.1 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  27.92 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  27.47 
 
 		 244 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  26.06 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  26.06 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  32.07 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2660  pantothenate kinase  33.46 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1765  pantothenate kinase  31.18 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  38.85 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  29.15 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  29.15 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  25.36 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  30.73 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  29.15 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  37.18 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2715  putative transcriptional activator, Baf family  29.63 
 
 		 255 aa  75.5  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  30.73 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  26.97 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  33.85 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  29.48 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  23.65 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  32.86 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  29.15 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0452  pantothenate kinase  28.62 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3000  pantothenate kinase  25.18 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0578  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.14 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  29.24 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  27.56 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  25.21 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  26.79 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  27.59 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0294  pantothenate kinase  29.85 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2285  pantothenate kinase  27.21 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  31.68 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3272  pantothenate kinase  26.34 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  31.62 
 
 		 249 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  26.71 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1811  pantothenate kinase  29.96 
 
 		 262 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  31.64 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>