229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0468 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  100 
 
 		 249 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  94.78 
 
 		 249 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  93.98 
 
 		 249 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  88.76 
 
 		 249 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  66.53 
 
 		 249 aa  350  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  64.52 
 
 		 249 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  64.11 
 
 		 249 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  63.05 
 
 		 248 aa  311  9e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  63.31 
 
 		 248 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  61.04 
 
 		 249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  57.77 
 
 		 251 aa  289  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  37.05 
 
 		 279 aa  128  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  39.15 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  30.45 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.38 
 
 		 252 aa  96.3  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 245 aa  92  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3997  Baf family transcriptional activator  32.17 
 
 		 246 aa  89.4  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000868707  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  35.02 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  28.33 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  31.46 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  29.92 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  36.31 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  35.03 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  29.5 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  28.46 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  32.06 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4379  pantothenate kinase  28.12 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.174078 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  29.5 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  25 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.53 
 
 		 269 aa  75.1  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  32.38 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.82 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  31.68 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0327  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.72 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  35.9 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  28.03 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  25.9 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  35.9 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.13 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  31.9 
 
 		 254 aa  72  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.14 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.44 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  28.19 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  28.19 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  33.85 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  30.23 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  31.32 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  29.3 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  30.47 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  30.47 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  28.95 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  28.95 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  28.95 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  28.95 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  28.95 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  28.95 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  26.57 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  26.57 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  37.69 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  31.03 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  25.62 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  28.57 
 
 		 259 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  25.62 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  29.09 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  32.94 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  30.54 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  29.84 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  33.55 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  28.21 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  34.34 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4005  transcriptional activator, Baf family  38.6 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2186  Baf family transcriptional activator  27.17 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  33.79 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  28.12 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  29.84 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35530  pantothenate kinase  31.33 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0754114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  28.48 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  30.04 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9156  pantothenate kinase  30.36 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1408  pantothenate kinase  35.77 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4483  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.55 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  24.33 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  36.13 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3423  putative Baf family transcriptional acitvator  30.36 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.354519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  26.67 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  27.31 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1868  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.92 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0248735  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  27.24 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0136  pantothenate kinase  24.58 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000027573  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  30.92 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  28.74 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8379  pantothenate kinase  33.14 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4713  Baf family transcriptional activator  29.56 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.073438  hitchhiker  0.000383315 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  30.92 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4446  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.28 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1198  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0081  putative transcriptional acitvator, Baf family  24.73 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4278  Baf family transcriptional activator  29.56 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1426  pantothenate kinase  31.29 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.264053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>