208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1947 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  100 
 
 		 248 aa  506  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  29.69 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  30.12 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.56 
 
 		 255 aa  92  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  30.2 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  28.1 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.45 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  26.27 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3997  Baf family transcriptional activator  47.06 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000868707  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  29.88 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  30 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  33.7 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  24.31 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  29.76 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  27.55 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  24.31 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  22.75 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  27.92 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  25.49 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  36.09 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  28.08 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  27.52 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  26.3 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  29.5 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  29.6 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  27.78 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  29.5 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  29.5 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  29.84 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.28 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  28.46 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  22.22 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4022  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.82 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147612 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  22.75 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  25.68 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  33.99 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  34.51 
 
 		 244 aa  72  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  31.29 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  26.64 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  27.19 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0452  pantothenate kinase  29.34 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  24.51 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  24.02 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  25.29 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  25.68 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  29.19 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  27 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  25.77 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  28.31 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  29.69 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1367  pantothenate kinase  26.56 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.37 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  30.64 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  29.17 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  27.13 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  24.24 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.59 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  24.24 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  24.24 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  24.24 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  24.24 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  24.24 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.17 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  24.07 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  28.29 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  25.57 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  26.15 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  31.66 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  26.15 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  26.15 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  35 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  26.83 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.65 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  28.27 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0146  pantothenate kinase  27.27 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  24.9 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0535  pantothenate kinase  28.89 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0719768  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.75 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  24.1 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.33 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02843  pantothenate kinase  33.12 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  27.92 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  28.29 
 
 		 256 aa  62  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  27.87 
 
 		 264 aa  62  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  25.18 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2715  putative transcriptional activator, Baf family  28.57 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  27.91 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  31.37 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1265  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.77 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2285  pantothenate kinase  25.5 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  24.88 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  28.75 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  26.54 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0064  pantothenate kinase  23.79 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0061  pantothenate kinase  23.79 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0061  pantothenate kinase  23.79 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  26.7 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0073  pantothenate kinase  23.79 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>