237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0550 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  100 
 
 
258 aa  520  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  100 
 
 
258 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  85.77 
 
 
254 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  82.68 
 
 
256 aa  431  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  80.48 
 
 
256 aa  407  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  75.59 
 
 
255 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  75 
 
 
284 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  76.08 
 
 
255 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  74.7 
 
 
255 aa  388  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  69.96 
 
 
254 aa  362  3e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  63.95 
 
 
262 aa  326  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  36.82 
 
 
289 aa  148  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  37.5 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  42.11 
 
 
245 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  38.04 
 
 
238 aa  145  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  36.63 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  35.96 
 
 
270 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  35.98 
 
 
262 aa  125  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  36.74 
 
 
259 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  35.98 
 
 
262 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  37.36 
 
 
256 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  37.36 
 
 
256 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  37.36 
 
 
256 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  37.36 
 
 
256 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  37.36 
 
 
256 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  35.69 
 
 
262 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  36.98 
 
 
256 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  35.52 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  34.91 
 
 
293 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  35.5 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  35.52 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  35.52 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  33.99 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  35.14 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  29.02 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  35.57 
 
 
246 aa  116  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  34.69 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  36.46 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  35.66 
 
 
244 aa  112  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  33.08 
 
 
253 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  34.17 
 
 
275 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  40.53 
 
 
254 aa  93.2  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  30.56 
 
 
256 aa  92.8  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.33 
 
 
249 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  28.17 
 
 
249 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  29.37 
 
 
249 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  25.87 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  32.08 
 
 
270 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.75 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  24.81 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.33 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  30.04 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  30.12 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  29.88 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  27.38 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  24.31 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  30.8 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  28.79 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  30.29 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.74 
 
 
254 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  28.79 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  30.36 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  30.04 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  28.19 
 
 
245 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3950  transcriptional activator, Baf family  31.64 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.151216  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  27.82 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0160  pantothenate kinase  32.34 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02843  pantothenate kinase  32.54 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  35.66 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  29.39 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  33.48 
 
 
254 aa  72  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  28.25 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.63 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  28.4 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  28.52 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  28.4 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.74 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.86 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  28.06 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  30 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  27.73 
 
 
249 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  30.61 
 
 
253 aa  68.6  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  30.85 
 
 
221 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2882  pantothenate kinase  32.74 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  27.8 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  35.37 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0061  pantothenate kinase  34.62 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  27.34 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0064  pantothenate kinase  34.62 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0065  pantothenate kinase  34.62 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0061  pantothenate kinase  34.62 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0061  pantothenate kinase  34.62 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  25.66 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0065  pantothenate kinase  34.62 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0077  pantothenate kinase  34.62 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.02884  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4983  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.62 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442209  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1093  putative transcriptional activator, Baf family  29.8 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.040353  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4483  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.65 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00680  pantothenate kinase  33.12 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  25.66 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>