181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0234 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  100 
 
 
243 aa  484  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02843  pantothenate kinase  71.01 
 
 
242 aa  289  3e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  60.76 
 
 
242 aa  265  5.999999999999999e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  63.78 
 
 
221 aa  232  3e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  38.49 
 
 
246 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  31.56 
 
 
266 aa  106  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  31.69 
 
 
256 aa  95.9  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.26 
 
 
255 aa  94.4  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  29.29 
 
 
249 aa  93.6  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  32.94 
 
 
262 aa  92  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  33.33 
 
 
254 aa  89.4  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  30.29 
 
 
254 aa  89  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  30.37 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  32.02 
 
 
284 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  29.05 
 
 
255 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.51 
 
 
269 aa  87  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.64 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  31.12 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  31.12 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  31.14 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  30.45 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  29.6 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  32.34 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  30.96 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  29.39 
 
 
270 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  27.39 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  31.47 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  31.47 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  31.47 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  31.47 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  31.47 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  31.47 
 
 
256 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  33.33 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  30.49 
 
 
266 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  31.17 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  29.11 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  31.28 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  32.8 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  32.64 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  29.78 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  32.3 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  30.2 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  30.2 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  30.36 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  32.8 
 
 
262 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  33.51 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  32.57 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  30.95 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  31.17 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  40.31 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  28.74 
 
 
255 aa  72  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  28.09 
 
 
244 aa  72  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  31.37 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  30.32 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  33.33 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  30.89 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  29.67 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  31.41 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.51 
 
 
254 aa  67  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  31.74 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  29.37 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  30.65 
 
 
248 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  30.26 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  30.26 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  29.24 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  30.26 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  27.2 
 
 
254 aa  65.1  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  29.08 
 
 
242 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  29.08 
 
 
242 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  26.36 
 
 
249 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  32.3 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  32.82 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.47 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  27.99 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  26.23 
 
 
263 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  31.45 
 
 
249 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  31.68 
 
 
266 aa  58.9  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  26.69 
 
 
244 aa  58.5  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.24 
 
 
253 aa  57.8  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  28.92 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  28.49 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0452  transcriptional activator, putative, Baf family  32.28 
 
 
241 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0613  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.28 
 
 
241 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  27.01 
 
 
254 aa  55.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  48.57 
 
 
249 aa  55.8  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  27.01 
 
 
254 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23250  transcriptional activator, putative, Baf family  26.92 
 
 
256 aa  55.5  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  27.59 
 
 
255 aa  55.5  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.31 
 
 
254 aa  55.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  32.28 
 
 
266 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  29.8 
 
 
242 aa  55.1  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2784  pantothenate kinase  20.4 
 
 
259 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2470  pantothenate kinase  20.4 
 
 
259 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4983  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.53 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442209  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2217  pantothenate kinase  27.69 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  28.65 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  26.4 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1518  pantothenate kinase  29.88 
 
 
260 aa  53.1  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  26.54 
 
 
263 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.51 
 
 
254 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>