226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1780 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  100 
 
 		 246 aa  486  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  35.71 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  39.76 
 
 		 262 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  35.57 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  35.57 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  35.95 
 
 		 238 aa  115  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  38.59 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  35.16 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  35.5 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  34.4 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  35.5 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  35.5 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  35.5 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  35.5 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  35.5 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  35.83 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  36.14 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  35.02 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  38.25 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  35.8 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  32.54 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  35.57 
 
 		 266 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  30.12 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  35.27 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  32.68 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  33.88 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  33.94 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  32.67 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  38.49 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  32.08 
 
 		 253 aa  99.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  32.54 
 
 		 256 aa  99.4  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  35.57 
 
 		 266 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  39.39 
 
 		 254 aa  99  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  33.6 
 
 		 242 aa  98.6  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  32.14 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  35.18 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  35.18 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  34.73 
 
 		 254 aa  96.3  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  32.79 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  33.07 
 
 		 262 aa  95.5  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  32.79 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  33.06 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  33.2 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  34.11 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  34.3 
 
 		 277 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.95 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  32.79 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  32.97 
 
 		 295 aa  91.3  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  29.02 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  37.63 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.64 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  29.25 
 
 		 251 aa  89.7  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  33.84 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  29.8 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  33.14 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.91 
 
 		 255 aa  88.6  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  27.06 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  31.97 
 
 		 293 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  31.6 
 
 		 293 aa  85.9  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  34.15 
 
 		 279 aa  85.5  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  32.26 
 
 		 249 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.4 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  30.89 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  29.92 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3997  Baf family transcriptional activator  29.28 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000868707  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  37.58 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  35.37 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  29.51 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.52 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02843  pantothenate kinase  36.15 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  32.9 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  29.92 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  26.92 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  25.4 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  25.6 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.78 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  29.02 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.96 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  40.36 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  25.58 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  25.58 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  25.86 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  25.98 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  32.67 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  28.3 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  31.37 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  31.37 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  30.19 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  27.95 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  31.37 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  29.64 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2784  pantothenate kinase  24.62 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2470  pantothenate kinase  24.62 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  25.38 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  25.56 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.63 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02240  transcriptional activator, putative, Baf family  25.9 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.22 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>