219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4563 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  100 
 
 		 249 aa  497  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  85.54 
 
 		 249 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  67.34 
 
 		 249 aa  358  5e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  66.53 
 
 		 249 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  64.92 
 
 		 249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  64.92 
 
 		 249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  64.11 
 
 		 249 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  63.71 
 
 		 248 aa  307  8e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  62.9 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  61.69 
 
 		 248 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  60.4 
 
 		 251 aa  287  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  35.29 
 
 		 279 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  38.14 
 
 		 244 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  32.24 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.04 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  30.95 
 
 		 258 aa  98.6  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  30.95 
 
 		 258 aa  98.6  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  31.4 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  30.28 
 
 		 255 aa  94.4  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  30.16 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  29.08 
 
 		 255 aa  92  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  29.13 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  33.51 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  33.92 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  29.25 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  40.37 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  34.81 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  29.25 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  38.31 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  37.66 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3997  Baf family transcriptional activator  29.31 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000868707  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  29.18 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  31.48 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.78 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  30.04 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  23.43 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  23.43 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  31.61 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  32.34 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  32.69 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  29.3 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  37.8 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  27.71 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  30.6 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.87 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  32.61 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  33.93 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  25.83 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  25.94 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  30.28 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  32.74 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  34.85 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  32.74 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  31.25 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  27.11 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  33.96 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  29.01 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.93 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  28.91 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  31.55 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  28.52 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  28.52 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  28.52 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  28.52 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  28.52 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  27.03 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  28.52 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  27.91 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  32.74 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  28.63 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  37.58 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  27.17 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1907  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.94 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  24.27 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.87 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  30 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  26.67 
 
 		 289 aa  62  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  28.74 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4379  pantothenate kinase  25.87 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.174078 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  32.74 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  27.51 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  27.51 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  28.87 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  24.31 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3950  transcriptional activator, Baf family  31.29 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.151216  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  26.85 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  29.73 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1093  putative transcriptional activator, Baf family  25.9 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.040353  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  28.88 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  28.12 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  32.14 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  24.69 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.68 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  25.52 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  29.45 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  32.74 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.16 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  26.21 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>