240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3756 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  100 
 
 
238 aa  479  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  47.88 
 
 
245 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  39.42 
 
 
262 aa  169  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  40.48 
 
 
254 aa  151  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  36.65 
 
 
255 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  37.94 
 
 
262 aa  145  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  38.04 
 
 
258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  38.04 
 
 
258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  37.45 
 
 
255 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  38.8 
 
 
254 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  36.82 
 
 
284 aa  141  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  34.51 
 
 
256 aa  135  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  36.95 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  36.36 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  38.98 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  36.86 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  36.86 
 
 
256 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  36.86 
 
 
256 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  36.86 
 
 
256 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  36.86 
 
 
256 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  36.86 
 
 
256 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  38.04 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  35.2 
 
 
262 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  35.37 
 
 
262 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  36.47 
 
 
270 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  34.96 
 
 
266 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  36.25 
 
 
256 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  36.96 
 
 
293 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  35.37 
 
 
266 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  37 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  35.08 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  35.37 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  35.37 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  35.51 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  35.18 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  32.77 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  35.95 
 
 
246 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.66 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  37.18 
 
 
277 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  33.33 
 
 
289 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  35.53 
 
 
275 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  36 
 
 
256 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  32.81 
 
 
266 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  40.11 
 
 
254 aa  98.6  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  36.55 
 
 
253 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  30.28 
 
 
244 aa  90.9  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  31.38 
 
 
242 aa  89  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  31.51 
 
 
242 aa  86.3  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  31.84 
 
 
248 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  31.09 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  29.34 
 
 
244 aa  81.6  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  31.65 
 
 
245 aa  81.6  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  26.8 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  32.35 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  28.74 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3950  transcriptional activator, Baf family  30.61 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.151216  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  27.34 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  31.56 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  35.5 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  36.59 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  26.67 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.06 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  25.79 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0613  putative transcriptional acitvator, Baf family  40.35 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  28.57 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0452  transcriptional activator, putative, Baf family  40.35 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  31.28 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02843  pantothenate kinase  33.86 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.01 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.96 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  39.74 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  40.77 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  34.12 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  32.37 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1265  putative transcriptional acitvator, Baf family  24.6 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0578  putative transcriptional acitvator, Baf family  24.43 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  31.29 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  34.09 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  26.98 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  22.92 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2784  pantothenate kinase  24.81 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2470  pantothenate kinase  24.81 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  29.78 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  26.98 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  28.12 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  28.12 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  32.48 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2997  pantothenate kinase  25.99 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  28.68 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  30.59 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  26.09 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  26.09 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  33.33 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  33.93 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0136  pantothenate kinase  26.21 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000027573  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.38 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  34 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3123  pantothenate kinase  25.99 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  26.8 
 
 
269 aa  68.6  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  27.73 
 
 
254 aa  68.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>