234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3839 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  100 
 
 
262 aa  523  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  63.95 
 
 
258 aa  326  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  62.5 
 
 
255 aa  326  3e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  63.95 
 
 
258 aa  326  3e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  63.67 
 
 
254 aa  322  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  60.38 
 
 
255 aa  321  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  64.2 
 
 
254 aa  318  6e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  62.55 
 
 
256 aa  315  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  63.92 
 
 
256 aa  310  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  61.78 
 
 
284 aa  308  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  60.55 
 
 
255 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  40.32 
 
 
262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  37.94 
 
 
238 aa  145  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  35.09 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  35.82 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  35.07 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  35.45 
 
 
262 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  38.58 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  34.46 
 
 
256 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  34.46 
 
 
256 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  34.46 
 
 
256 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  34.46 
 
 
256 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  34.46 
 
 
256 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  34.46 
 
 
256 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  35.14 
 
 
266 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  35.34 
 
 
270 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  35.14 
 
 
266 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  33.7 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  34.96 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  34.75 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  34.75 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  36.36 
 
 
277 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  36.2 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  30.5 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  36.23 
 
 
293 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  35.71 
 
 
295 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  33.73 
 
 
244 aa  102  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  32.81 
 
 
248 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.83 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  32.96 
 
 
256 aa  97.8  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  33.07 
 
 
246 aa  95.5  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  32.41 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  35.69 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  30.55 
 
 
270 aa  91.3  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  31.08 
 
 
279 aa  86.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  32.94 
 
 
243 aa  85.1  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  35.96 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.63 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.71 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  29.96 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  31.94 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  31.37 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  28.52 
 
 
245 aa  79  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  29.65 
 
 
242 aa  79  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.14 
 
 
255 aa  77  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  30.31 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  26.22 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.85 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  27.94 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  29.15 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  28.57 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  27.87 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  27.56 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  28.29 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  27.52 
 
 
242 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  25.83 
 
 
255 aa  72  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  28.91 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  30.77 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  31.32 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.86 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  25.56 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  28.3 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  26.62 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1296  Baf family transcriptional activator  30.45 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  27.11 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  31.8 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.8 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1480  pantothenate kinase  32.77 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0377381  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  27.13 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  39.52 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.755587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.63 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  25 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  24.91 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  29.89 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2186  Baf family transcriptional activator  30.23 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3950  transcriptional activator, Baf family  32.44 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.151216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0160  pantothenate kinase  25.67 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02843  pantothenate kinase  30.04 
 
 
242 aa  67  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2285  pantothenate kinase  27.44 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  32.72 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2217  pantothenate kinase  29.35 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  27.08 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  27.08 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00680  pantothenate kinase  27.84 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  38.71 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  38.71 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3000  pantothenate kinase  26.94 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.34 
 
 
252 aa  65.1  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0636  putative transcriptional acitvator, Baf family  34.76 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2229  pantothenate kinase  36.2 
 
 
259 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.8886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>