233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2817 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  100 
 
 
262 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  98.85 
 
 
262 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  93.13 
 
 
262 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  96.41 
 
 
266 aa  474  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  94.88 
 
 
266 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  94.42 
 
 
265 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  94.42 
 
 
265 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  72.97 
 
 
259 aa  361  6e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  72.44 
 
 
256 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  72.44 
 
 
256 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  72.44 
 
 
256 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  72.44 
 
 
256 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  72.44 
 
 
256 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  72.44 
 
 
256 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  68.94 
 
 
270 aa  338  5e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  68.48 
 
 
270 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  63.57 
 
 
289 aa  329  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  42.96 
 
 
275 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  42.75 
 
 
277 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  40.29 
 
 
293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  40.14 
 
 
295 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  40 
 
 
293 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  35.45 
 
 
262 aa  129  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  38.7 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  42.47 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  36.96 
 
 
262 aa  125  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  35 
 
 
254 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  35.37 
 
 
238 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  35.77 
 
 
284 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  35.69 
 
 
258 aa  123  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  35.69 
 
 
258 aa  123  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  35.74 
 
 
256 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  33.59 
 
 
266 aa  122  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  32.43 
 
 
255 aa  121  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  33.2 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  36.92 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  33.98 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  35.8 
 
 
246 aa  106  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  33.72 
 
 
256 aa  99.4  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  35.88 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  41.52 
 
 
254 aa  91.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  31.48 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.09 
 
 
269 aa  90.5  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  31.2 
 
 
251 aa  89.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  28.57 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  39.39 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02843  pantothenate kinase  32.42 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23250  transcriptional activator, putative, Baf family  30.52 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  31.08 
 
 
248 aa  79  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  30.41 
 
 
255 aa  79  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0958  pantothenate kinase  28.46 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  23.13 
 
 
255 aa  77  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  25.84 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3221  pantothenate kinase  28.09 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  29.19 
 
 
257 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  29.01 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  25.66 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  29.03 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  29.46 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  30.4 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  29.71 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  24.26 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  25.19 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  25.19 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  31.07 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  29.8 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  25.59 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  25.49 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  25.29 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  31.15 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  28.86 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  28.48 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2715  putative transcriptional activator, Baf family  30.37 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  28.03 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  30.92 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  28.09 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  32.53 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1765  pantothenate kinase  34.97 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  28.09 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  31.9 
 
 
240 aa  68.6  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  23.44 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  29.25 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  28.96 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  25.56 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  26.05 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  29.17 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  33.57 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  29.34 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  31.84 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  27.23 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.65 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.74 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  29.46 
 
 
242 aa  67  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0452  pantothenate kinase  28.35 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1811  pantothenate kinase  31.37 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  32.94 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02240  transcriptional activator, putative, Baf family  33.33 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0535  pantothenate kinase  21.84 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0719768  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2784  pantothenate kinase  23.35 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2470  pantothenate kinase  23.35 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>