246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3391 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  100 
 
 
254 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  69.96 
 
 
258 aa  362  3e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  69.96 
 
 
258 aa  362  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  66.4 
 
 
255 aa  357  9e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  67.59 
 
 
254 aa  348  7e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  65.61 
 
 
255 aa  345  3e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  66.8 
 
 
256 aa  344  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  66.4 
 
 
255 aa  341  5.999999999999999e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  67.19 
 
 
256 aa  335  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  64.06 
 
 
284 aa  332  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  64.2 
 
 
262 aa  318  6e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  41.13 
 
 
262 aa  159  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  40.48 
 
 
238 aa  151  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  44.4 
 
 
245 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  38.27 
 
 
289 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  41.51 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  41.51 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  41.51 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  41.51 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  41.51 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  39.08 
 
 
262 aa  132  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  41.51 
 
 
256 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  40.38 
 
 
259 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  38.7 
 
 
262 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  38.7 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  37.78 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  38.04 
 
 
266 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  37.98 
 
 
266 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  38.04 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  38.04 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  38.06 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  37.91 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  35.5 
 
 
248 aa  116  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  38.37 
 
 
244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  30.43 
 
 
266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  33.82 
 
 
293 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  35.29 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  38.08 
 
 
277 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  34.73 
 
 
246 aa  96.3  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  31.44 
 
 
253 aa  93.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  44 
 
 
254 aa  94  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  36.79 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  34.01 
 
 
242 aa  89  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  32.56 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.86 
 
 
269 aa  85.9  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  30.23 
 
 
242 aa  86.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.03 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  34.91 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  31.89 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02843  pantothenate kinase  33.64 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  32.93 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  29.74 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  30.36 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  29.31 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.59 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  27.2 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  33.33 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.14 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.98 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  28.88 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  28.46 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  25.68 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  29.25 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  34.67 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  29.48 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  29.12 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  30.2 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00931  transcriptional regulator  23.93 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.73 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  29.25 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.23 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  28.79 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  28.46 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  28.57 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  33.67 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  28.57 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  28.57 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  36.55 
 
 
255 aa  67  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  28.57 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  28.33 
 
 
268 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1868  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.36 
 
 
254 aa  67  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0248735  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1093  putative transcriptional activator, Baf family  31.61 
 
 
248 aa  67  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.040353  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  25.58 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.75 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  29.08 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  25.64 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.59 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  27.13 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  33.85 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  27.61 
 
 
274 aa  65.1  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  25.23 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  27.17 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  31.88 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00680  pantothenate kinase  27.01 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  29.2 
 
 
254 aa  63.9  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  29.08 
 
 
248 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  32.54 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  26.82 
 
 
254 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  31.78 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  30.47 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>