212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0977 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  100 
 
 		 249 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  32.41 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  32.82 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  33.04 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.05 
 
 		 255 aa  88.6  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  33.63 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  32.02 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  32.46 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  29.64 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  31.5 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  29.27 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  32.27 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  30.2 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  29.67 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  34.14 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  30.45 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  31.39 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  30.94 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  27.27 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  28.1 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  33.57 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  29.39 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  28.14 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  30.4 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  29.3 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  27.86 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  28.57 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  31.3 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  27.67 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  34.59 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  27.95 
 
 		 255 aa  72  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  33.09 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  36.42 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  31.61 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  30.47 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  29.84 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  41.82 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  30.32 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.25 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  29.68 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3000  pantothenate kinase  26.82 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  34.85 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0160  pantothenate kinase  32 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144798  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  30.29 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2285  pantothenate kinase  28.19 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  30.41 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.61 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  30.04 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  30.36 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  36.75 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  38.6 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  33.47 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  29.17 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.25 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1772  pantothenate kinase  26.56 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.58 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  26.58 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  30.11 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  31.17 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 255 aa  62  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  30.91 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.85 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1724  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.91 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.345789  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  28.15 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2186  Baf family transcriptional activator  29.7 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4379  pantothenate kinase  30 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.174078 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02240  transcriptional activator, putative, Baf family  30.38 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1868  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.33 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0248735  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  24.51 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  28.94 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  30.94 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  27.33 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  25.67 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  28.9 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00680  pantothenate kinase  27.92 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  29.69 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1296  Baf family transcriptional activator  28.66 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  26.67 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0136  pantothenate kinase  26.7 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000027573  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1518  pantothenate kinase  28.95 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  26.13 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  29.69 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.91 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  28.9 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  29.33 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2865  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.29 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.33 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  31.97 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4005  transcriptional activator, Baf family  34.86 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  31.97 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  28.9 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  28.9 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  28.9 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  28.9 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  28.9 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>