205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03572 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  100 
 
 		 252 aa  526  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3997  Baf family transcriptional activator  33.79 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000868707  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  30.12 
 
 		 249 aa  112  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  30.74 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  31.3 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  28.63 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  30.67 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  30.04 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  28.63 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  27.6 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  29.46 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  30.36 
 
 		 242 aa  99  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  32.5 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  30.45 
 
 		 249 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  28.83 
 
 		 249 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  28.7 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  28.83 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  29.05 
 
 		 245 aa  92.8  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  29.64 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  30.77 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  27.67 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  32 
 
 		 249 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  31.45 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  27.45 
 
 		 256 aa  86.7  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  26.53 
 
 		 245 aa  85.9  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  27.35 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.2 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  31.93 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  27.85 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.32 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  26.59 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  28.51 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  28.85 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  27.86 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  27.86 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  24.03 
 
 		 295 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  28.16 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  27.85 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  27.93 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  27.03 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  25.29 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  24.12 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02843  pantothenate kinase  29.63 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  25.69 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  26.42 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  27.14 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  24.52 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  23.19 
 
 		 293 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  33.59 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  24.8 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  23.83 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  23.83 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  27.34 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  24.81 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  28.51 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  23.31 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  23.31 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  23.31 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  23.31 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  23.31 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  30.25 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  29.08 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  23.31 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.61 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  26.58 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  23.55 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  27.41 
 
 		 221 aa  62  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.95 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  23.86 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  21.72 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1772  pantothenate kinase  24.46 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1367  pantothenate kinase  25 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  22.89 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3272  pantothenate kinase  26.78 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  23.51 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  29.41 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  23.48 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  23.83 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  25 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1765  pantothenate kinase  27.74 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  27.67 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  22.99 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.73 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  28.85 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0217  pantothenate kinase  26.46 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  28.85 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  28.85 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  30.22 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2784  pantothenate kinase  26.92 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2470  pantothenate kinase  26.92 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1408  pantothenate kinase  27.04 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  30.17 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  30.77 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3123  pantothenate kinase  24.79 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  31.06 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  25.41 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.89 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00901  transcriptional regulator  26.77 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66751  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2715  putative transcriptional activator, Baf family  27.31 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>