127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02843 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02843  pantothenate kinase  100 
 
 
242 aa  475  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  71.01 
 
 
243 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  60.58 
 
 
242 aa  277  1e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  60.55 
 
 
221 aa  247  1e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  30 
 
 
269 aa  108  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  34.4 
 
 
256 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  34.4 
 
 
256 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  34.4 
 
 
256 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  34.4 
 
 
256 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  34.4 
 
 
256 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  34.4 
 
 
256 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  33.46 
 
 
289 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  34.27 
 
 
259 aa  96.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  30.65 
 
 
270 aa  96.7  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.43 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  33.74 
 
 
254 aa  92.4  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  37.5 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  29.46 
 
 
249 aa  91.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  32.1 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  33.06 
 
 
256 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  33.2 
 
 
262 aa  89.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  33.2 
 
 
262 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  31.47 
 
 
270 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  32.28 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  32.52 
 
 
266 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  32.79 
 
 
262 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  32.11 
 
 
293 aa  85.1  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  32.24 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  32.24 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  31.7 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  30.94 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  30.86 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  30.86 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  35.1 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  28.57 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  36.07 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  30.29 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.48 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  29.48 
 
 
255 aa  79  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  31.3 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  33.2 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  31.47 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  32.43 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  33.86 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  29.51 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  30.84 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  39.52 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  28.93 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  30.24 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  28.98 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  28.38 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  28.87 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  32.27 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  28.33 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  27.75 
 
 
268 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  30.73 
 
 
249 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  30.74 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  29 
 
 
248 aa  63.5  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  30.21 
 
 
249 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  30.73 
 
 
249 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  30.94 
 
 
266 aa  62.4  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  30.72 
 
 
248 aa  61.6  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  28.69 
 
 
275 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  26.86 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  32.14 
 
 
255 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  28.14 
 
 
262 aa  59.7  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.86 
 
 
254 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  26.78 
 
 
249 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  29.02 
 
 
257 aa  59.7  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  26.7 
 
 
263 aa  58.5  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  27.4 
 
 
279 aa  58.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  29.02 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  29.02 
 
 
249 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  46.48 
 
 
266 aa  55.1  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  25.21 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  26.51 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  25.79 
 
 
263 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  31.87 
 
 
261 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.16 
 
 
254 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.92 
 
 
249 aa  52.4  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  28.63 
 
 
245 aa  52.4  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  26.79 
 
 
274 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  34.3 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23250  transcriptional activator, putative, Baf family  28.4 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1408  pantothenate kinase  33.33 
 
 
270 aa  50.1  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  28.74 
 
 
260 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  29.55 
 
 
242 aa  49.7  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  29.15 
 
 
242 aa  49.3  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  29.3 
 
 
242 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  35.44 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1772  pantothenate kinase  25.22 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  28.24 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1093  putative transcriptional activator, Baf family  24.08 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.040353  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  20.73 
 
 
252 aa  46.2  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2217  pantothenate kinase  26.5 
 
 
263 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  32.67 
 
 
257 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  32.67 
 
 
257 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  35.53 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1294  pantothenate kinase  29.71 
 
 
261 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  21.9 
 
 
254 aa  44.7  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>