226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1675 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  100 
 
 		 269 aa  548  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  72.86 
 
 		 270 aa  409  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  34.75 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  31.66 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  29.55 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  30.32 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  28.68 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  28.68 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  28.68 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  28.68 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  28.68 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  28.68 
 
 		 256 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  30.83 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02843  pantothenate kinase  30.45 
 
 		 242 aa  97.8  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  30.11 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  28.68 
 
 		 259 aa  96.3  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  29.07 
 
 		 244 aa  95.5  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  28.95 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  28.92 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  30.11 
 
 		 293 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  33.64 
 
 		 295 aa  92.4  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  29.21 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  28.78 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  28.09 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  29.59 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  28.81 
 
 		 242 aa  89.7  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  28.09 
 
 		 262 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  29.88 
 
 		 270 aa  89  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  31.75 
 
 		 256 aa  88.6  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  31.54 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  31.94 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  31.28 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  31.09 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  36.49 
 
 		 221 aa  87  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  29.68 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  31.27 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  29.68 
 
 		 265 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  29.68 
 
 		 265 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  32.7 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  32.86 
 
 		 254 aa  85.9  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  32.24 
 
 		 284 aa  85.5  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  31.75 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  31.75 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  26.23 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  32.7 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  31.34 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  26.19 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  32 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  27.07 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  28.63 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  26.69 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  28.63 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  32.09 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  32.86 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  28.57 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  29.59 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.32 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  26.92 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  29.13 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  29.28 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  27.53 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  31.36 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  30.18 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  29.93 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1765  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  28.9 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  30.87 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  33.92 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  33.82 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.7 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  24.81 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3997  Baf family transcriptional activator  32.89 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000868707  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  24.44 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  44.19 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  25.19 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  28.85 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0578  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.32 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  25.43 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  30.92 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1724  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.67 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.345789  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0958  pantothenate kinase  28.57 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  32.76 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  25.73 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  31.06 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1518  pantothenate kinase  31.64 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3123  pantothenate kinase  27.12 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2715  putative transcriptional activator, Baf family  37.17 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  26.09 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  25.73 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  38.16 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.2 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  33.07 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  29.93 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  37.63 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0238  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.25 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  33.07 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  26.78 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.755587 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  25.43 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  27.41 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>