230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2920 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  100 
 
 
266 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  99.6 
 
 
265 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  99.6 
 
 
265 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  93.85 
 
 
262 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  93.08 
 
 
262 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  94.42 
 
 
266 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  90.98 
 
 
262 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  74.13 
 
 
259 aa  364  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  73.23 
 
 
256 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  73.23 
 
 
256 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  73.23 
 
 
256 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  73.23 
 
 
256 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  73.23 
 
 
256 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  73.23 
 
 
256 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  69.08 
 
 
270 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  68.87 
 
 
270 aa  330  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  62.59 
 
 
289 aa  316  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  43.88 
 
 
275 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  42.39 
 
 
277 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  38.75 
 
 
293 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  39.13 
 
 
295 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  38.75 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  36.12 
 
 
262 aa  127  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  34.93 
 
 
262 aa  126  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  33.33 
 
 
266 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  33.33 
 
 
255 aa  123  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  38.22 
 
 
254 aa  123  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  32.58 
 
 
255 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  42.59 
 
 
245 aa  122  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  34.78 
 
 
238 aa  122  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  34.98 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  35.74 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  35.74 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  35.38 
 
 
284 aa  119  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  33.46 
 
 
254 aa  115  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  35.34 
 
 
256 aa  115  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  34.11 
 
 
255 aa  109  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  33.21 
 
 
256 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  35.41 
 
 
246 aa  99.8  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  30.36 
 
 
251 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  34.73 
 
 
253 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  40.24 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  29.56 
 
 
244 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.68 
 
 
269 aa  85.9  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  30.88 
 
 
270 aa  85.9  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  30.41 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02843  pantothenate kinase  32.16 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  38.79 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  29.39 
 
 
244 aa  79  0.00000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  23.19 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  31.2 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  25.84 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  29.73 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  31.01 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3221  pantothenate kinase  28.04 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  30.84 
 
 
242 aa  75.1  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23250  transcriptional activator, putative, Baf family  30.69 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  24.62 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  24.52 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  29.71 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  28.27 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  30.59 
 
 
254 aa  72  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  29.89 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  24.81 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  25.29 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  24.81 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  31.35 
 
 
221 aa  71.6  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  30.49 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  24.02 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  29.34 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  30.86 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  29.28 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  34.51 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.77 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  29.93 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  27.95 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  29.08 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  32.12 
 
 
240 aa  68.6  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.08 
 
 
254 aa  68.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  25.39 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1294  pantothenate kinase  31.25 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  28.75 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3000  pantothenate kinase  28.85 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  28.31 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0958  pantothenate kinase  28.46 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  28.33 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  28.33 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  30.23 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  31.33 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.36 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2285  pantothenate kinase  27.81 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  28.69 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2715  putative transcriptional activator, Baf family  30.37 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  26.35 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  29.69 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.36 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  24.12 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  27.54 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  27.06 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  29.3 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>