250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5203 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  100 
 
 		 240 aa  492  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  52.67 
 
 		 268 aa  246  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3272  pantothenate kinase  51.48 
 
 		 235 aa  224  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  41.32 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  38.84 
 
 		 244 aa  171  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  38.78 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  36.78 
 
 		 244 aa  149  4e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  36.14 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.8 
 
 		 252 aa  111  9e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  32.86 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1765  pantothenate kinase  29.69 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  35.67 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.47 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  31.37 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.96 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  35.59 
 
 		 261 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.31 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0958  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1408  pantothenate kinase  31.37 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  32.16 
 
 		 263 aa  99  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  30.98 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  27.13 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.755587 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  30.71 
 
 		 254 aa  98.6  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0544  pantothenate kinase  29.13 
 
 		 262 aa  97.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3221  pantothenate kinase  33.5 
 
 		 272 aa  97.1  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1518  pantothenate kinase  25.78 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0064  pantothenate kinase  28.85 
 
 		 262 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0065  pantothenate kinase  28.85 
 
 		 262 aa  96.3  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0061  pantothenate kinase  28.85 
 
 		 262 aa  96.3  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0061  pantothenate kinase  28.85 
 
 		 262 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0065  pantothenate kinase  28.85 
 
 		 262 aa  96.3  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0074  pantothenate kinase  28.85 
 
 		 262 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.335209 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0077  pantothenate kinase  28.85 
 
 		 262 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.02884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0061  pantothenate kinase  29.23 
 
 		 262 aa  96.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  27.13 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0073  pantothenate kinase  28.85 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  27.13 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5243  pantothenate kinase  28.85 
 
 		 262 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.141011 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 255 aa  95.5  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  32.28 
 
 		 255 aa  95.1  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2229  pantothenate kinase  27.41 
 
 		 259 aa  95.1  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0061  pantothenate kinase  30.3 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  29.27 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  29.08 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0065  pantothenate kinase  28.91 
 
 		 258 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000107258  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  28.95 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  29.01 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  28.24 
 
 		 264 aa  92.8  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0146  pantothenate kinase  30.47 
 
 		 254 aa  92.4  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4379  pantothenate kinase  29.48 
 
 		 250 aa  92.4  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.174078 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  29.13 
 
 		 256 aa  92.4  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  29.13 
 
 		 256 aa  92.4  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2285  pantothenate kinase  33.71 
 
 		 260 aa  92  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  29.13 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  35.33 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2186  Baf family transcriptional activator  31.25 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  29.13 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0081  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.25 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1294  pantothenate kinase  31.3 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0063  pantothenate kinase  27.63 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1724  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.63 
 
 		 266 aa  89.7  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.345789  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8379  pantothenate kinase  27.48 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3950  transcriptional activator, Baf family  27.82 
 
 		 275 aa  89.4  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.151216  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  33.96 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  29.41 
 
 		 255 aa  89.4  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3123  pantothenate kinase  27.78 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0136  pantothenate kinase  31.01 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000027573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  30.26 
 
 		 262 aa  89  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0424  Baf family transcriptional activator  28.79 
 
 		 255 aa  89  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00396752  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.79 
 
 		 253 aa  87.8  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0452  transcriptional activator, putative, Baf family  34.25 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  35 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0613  putative transcriptional acitvator, Baf family  34.25 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  29.96 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  29.71 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  29.57 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  26.84 
 
 		 255 aa  87  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4022  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.6 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147612 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1331  pantothenate kinase  26.38 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181075  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  31.76 
 
 		 258 aa  85.9  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3000  pantothenate kinase  35.33 
 
 		 260 aa  85.9  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02240  transcriptional activator, putative, Baf family  27.6 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1477  pantothenate kinase  29.49 
 
 		 255 aa  85.5  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148615  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  29.02 
 
 		 251 aa  85.1  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1063  pantothenate kinase  28.29 
 
 		 255 aa  85.1  9e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.156837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2882  pantothenate kinase  25.58 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2997  pantothenate kinase  27.38 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.52 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0327  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.05 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  27.19 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1296  Baf family transcriptional activator  29.92 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4446  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.01 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0762  pantothenate kinase  27.45 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  33.12 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1198  pantothenate kinase  29.53 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4983  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.67 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442209  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0113  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.06 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.164132 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  35.34 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2660  pantothenate kinase  38.24 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>