237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0777 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  100 
 
 		 254 aa  521  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  44.67 
 
 		 243 aa  199  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  41.87 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3272  pantothenate kinase  37.19 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.07 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  38.78 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  35.08 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  37.86 
 
 		 244 aa  142  5e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  30.87 
 
 		 268 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  29.2 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0958  pantothenate kinase  27.67 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1518  pantothenate kinase  27.71 
 
 		 260 aa  98.6  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1294  pantothenate kinase  32.48 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1765  pantothenate kinase  25.81 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0238  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.41 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.73 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.59 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0146  pantothenate kinase  28.85 
 
 		 254 aa  89.4  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1408  pantothenate kinase  34.9 
 
 		 270 aa  89  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3000  pantothenate kinase  31.33 
 
 		 260 aa  88.6  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  27.06 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  27.34 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2715  putative transcriptional activator, Baf family  32.11 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1296  Baf family transcriptional activator  28.74 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2660  pantothenate kinase  28.63 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0452  pantothenate kinase  29.53 
 
 		 275 aa  86.7  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2186  Baf family transcriptional activator  29.53 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0613  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.65 
 
 		 241 aa  86.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0452  transcriptional activator, putative, Baf family  28.65 
 
 		 241 aa  86.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  33.86 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  33.86 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.29 
 
 		 263 aa  85.9  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  27.38 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3950  transcriptional activator, Baf family  33.81 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.151216  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  27.91 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1477  pantothenate kinase  30.04 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148615  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  29.25 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  32.76 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  25.86 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  30.04 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4022  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.78 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147612 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23250  transcriptional activator, putative, Baf family  29.3 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.08 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.01 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  27.69 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  26.96 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3221  pantothenate kinase  28.45 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  27.41 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  30.93 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1367  pantothenate kinase  29.66 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  28.07 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  26.79 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  28.68 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  30 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00680  pantothenate kinase  30.57 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1218  pantothenate kinase  24.51 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0258135  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1801  pantothenate kinase  32.99 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2285  pantothenate kinase  30.74 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.39 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  27.52 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0578  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.95 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  34.56 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1811  pantothenate kinase  30.41 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  30.87 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  27.27 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  26.05 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  27.27 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3611  Baf family transcriptional activator  27.71 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  29.32 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2217  pantothenate kinase  28.57 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  30.51 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  37.6 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  27.34 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1164  Baf family transcriptional activator  34.27 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  26.24 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  27.13 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  26.5 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  26.84 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0160  pantothenate kinase  29.78 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144798  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4446  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.19 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.87 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  29.09 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  28.38 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0061  pantothenate kinase  28.57 
 
 		 262 aa  72  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  26.14 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.755587 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2229  pantothenate kinase  26.39 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0063  pantothenate kinase  27.78 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  29.8 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  27.74 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0065  pantothenate kinase  28.03 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000107258  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  25.33 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4170  pantothenate kinase  32.64 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  27.74 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  25.99 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  28.48 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  27.74 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  25.66 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>