238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3614 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  100 
 
 		 255 aa  519  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  76.68 
 
 		 256 aa  401  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  76.08 
 
 		 258 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  75.49 
 
 		 255 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  76.08 
 
 		 258 aa  395  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  75.89 
 
 		 254 aa  387  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  72.33 
 
 		 255 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  74.9 
 
 		 256 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  70.54 
 
 		 284 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  66.4 
 
 		 254 aa  341  5.999999999999999e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  60.55 
 
 		 262 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  36.84 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  36.95 
 
 		 238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  35.55 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  40 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  33.69 
 
 		 289 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  36.13 
 
 		 295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  34.81 
 
 		 270 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  34.91 
 
 		 293 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  34.25 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  35.47 
 
 		 259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  34.93 
 
 		 293 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  34.47 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  33.85 
 
 		 262 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  33.98 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  33.98 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  35.61 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  35.61 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  35.61 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  35.61 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  35.61 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  35.61 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  34.25 
 
 		 265 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  34.25 
 
 		 266 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  34.25 
 
 		 265 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  32.79 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  35.09 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  31.89 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  27.38 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  32.14 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  35.25 
 
 		 275 aa  96.3  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  38.95 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  30.08 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.7 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  28.17 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  27.56 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  28.97 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  27.11 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  27.24 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  32.31 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  28.46 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  27.38 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.89 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  27.63 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.82 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  23.19 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  27.45 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.46 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  28.41 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  24.05 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.53 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  29.32 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  22.75 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0160  pantothenate kinase  32.24 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144798  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  33.13 
 
 		 262 aa  72  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1296  Baf family transcriptional activator  29.77 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.97 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00931  transcriptional regulator  24.39 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  35.19 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  25.5 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00680  pantothenate kinase  28.25 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  27.37 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1093  putative transcriptional activator, Baf family  32.45 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.040353  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  29.49 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  27.09 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0061  pantothenate kinase  31.15 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  30.95 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  28.41 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4446  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.9 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  28.91 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.19 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  27.92 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0077  pantothenate kinase  31.15 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.02884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0064  pantothenate kinase  31.15 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0065  pantothenate kinase  31.15 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0061  pantothenate kinase  31.15 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0061  pantothenate kinase  31.15 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  25.64 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0065  pantothenate kinase  31.15 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0073  pantothenate kinase  31.15 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  28.96 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  29.21 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1480  pantothenate kinase  29.57 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0377381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0074  pantothenate kinase  31.15 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.335209 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.29 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  27.41 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  31.06 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  26.67 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>