231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4227 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  100 
 
 
270 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  88.48 
 
 
270 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  71.06 
 
 
289 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  68.63 
 
 
259 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  68.18 
 
 
262 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  68.24 
 
 
256 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  68.24 
 
 
256 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  68.24 
 
 
256 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  68.24 
 
 
256 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  68.24 
 
 
256 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  68.24 
 
 
256 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  67.8 
 
 
262 aa  332  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  68.87 
 
 
266 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  68.11 
 
 
266 aa  329  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  66.29 
 
 
262 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  68.9 
 
 
265 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  68.9 
 
 
265 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  39.29 
 
 
295 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  37.63 
 
 
293 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  37.68 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  40.07 
 
 
275 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  40.5 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  36.86 
 
 
258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  36.86 
 
 
258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  35.27 
 
 
262 aa  126  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  38.6 
 
 
254 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  40.75 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  32.84 
 
 
255 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  33.21 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  33.58 
 
 
256 aa  118  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  32.23 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  34.8 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  35.02 
 
 
238 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  34.69 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  34.07 
 
 
284 aa  112  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  29.89 
 
 
266 aa  112  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  34.87 
 
 
262 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  34.56 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  33.97 
 
 
246 aa  94.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  39.29 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.54 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  30.15 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  31.66 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  32.03 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  31.54 
 
 
248 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  30.08 
 
 
249 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  32.73 
 
 
221 aa  82  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02843  pantothenate kinase  31.86 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  32.08 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  30.39 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0958  pantothenate kinase  28.9 
 
 
260 aa  78.6  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  25.77 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  29.02 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  27.75 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  24.58 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  30.47 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  37.75 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  34.69 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  25.58 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  33.12 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.89 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  30.12 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  27.33 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  26.9 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  26.9 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  28.79 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.18 
 
 
242 aa  72  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1765  pantothenate kinase  31.52 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  31.76 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  33.11 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  29.3 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  28.84 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  32.3 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1724  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.94 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.345789  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3000  pantothenate kinase  27.61 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3221  pantothenate kinase  26.77 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2285  pantothenate kinase  29.89 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  27.96 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  27.91 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.45 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  27.84 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  24.03 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  26.04 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1408  pantothenate kinase  30.08 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  26.39 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  27.88 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  29.81 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  28.75 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  25.58 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0535  pantothenate kinase  22.01 
 
 
254 aa  67  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0719768  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  28.49 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  28.75 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  27.73 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0177  pantothenate kinase  26.56 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.676311  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.03 
 
 
268 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  27.91 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  27.45 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  28.12 
 
 
257 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.755587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  25.58 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  28.27 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>