232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0817 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  100 
 
 
249 aa  494  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  88.35 
 
 
248 aa  441  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  63.31 
 
 
248 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  63.71 
 
 
249 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  61.04 
 
 
249 aa  308  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  60.48 
 
 
249 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  61.45 
 
 
249 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  61.04 
 
 
249 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  61.45 
 
 
249 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  62.9 
 
 
249 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  56.4 
 
 
251 aa  268  8e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  34.69 
 
 
244 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  37.11 
 
 
279 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  35.08 
 
 
242 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  32.55 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  33.6 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  38.82 
 
 
254 aa  92  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.32 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  33.73 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  34.27 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  32.53 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.38 
 
 
269 aa  85.1  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  30.24 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  32.37 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  30.68 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  30.68 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  29.83 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3997  Baf family transcriptional activator  30.08 
 
 
246 aa  82  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000868707  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  30.91 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.06 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  30.12 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  30.89 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  30.27 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  31.47 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  33.74 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  32.87 
 
 
270 aa  79  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  30.27 
 
 
256 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  30.27 
 
 
256 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  30.27 
 
 
256 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  30.27 
 
 
256 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  30.27 
 
 
256 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  31.69 
 
 
238 aa  77  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  29.73 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  28.29 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  31.08 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  30.96 
 
 
244 aa  75.1  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  30.19 
 
 
262 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  28.46 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  28.69 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  30.12 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  29.32 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  29.63 
 
 
262 aa  72  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.5 
 
 
242 aa  72  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  27.09 
 
 
248 aa  72  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  28.76 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  29.63 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  29.44 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  29.44 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.63 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  30.99 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  29.48 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  32.08 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  26.55 
 
 
289 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4170  pantothenate kinase  27.2 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  25.21 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  27.49 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  29.33 
 
 
295 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  33.97 
 
 
254 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  34.07 
 
 
245 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  27.08 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  31.12 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3950  transcriptional activator, Baf family  32.3 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.151216  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  30.13 
 
 
274 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.69 
 
 
254 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  35.26 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.59 
 
 
254 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35530  pantothenate kinase  28.46 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0754114  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4446  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.19 
 
 
261 aa  62.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  27.47 
 
 
256 aa  62.4  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  29.03 
 
 
263 aa  62.4  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  27.91 
 
 
284 aa  62.4  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  29.75 
 
 
255 aa  62.4  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1164  Baf family transcriptional activator  27.59 
 
 
270 aa  62  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  28.02 
 
 
262 aa  62  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0061  pantothenate kinase  28.63 
 
 
262 aa  62  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0064  pantothenate kinase  26.95 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0065  pantothenate kinase  26.95 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0061  pantothenate kinase  26.95 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0061  pantothenate kinase  26.95 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.34 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0065  pantothenate kinase  26.95 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0327  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.12 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  28.24 
 
 
253 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0074  pantothenate kinase  26.95 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.335209 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0077  pantothenate kinase  26.95 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.02884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0073  pantothenate kinase  27.34 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1868  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.48 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0248735  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  33.56 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  25.83 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  26.26 
 
 
264 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>