245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0874 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  100 
 
 
254 aa  484  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  41.43 
 
 
256 aa  132  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  38.11 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  33.85 
 
 
266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  34.8 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  34.8 
 
 
256 aa  109  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  36.84 
 
 
238 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  36.14 
 
 
258 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  36.14 
 
 
258 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  36 
 
 
248 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  37.15 
 
 
246 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  35.59 
 
 
295 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  34.4 
 
 
255 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  36.36 
 
 
254 aa  102  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  33.71 
 
 
289 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  33.47 
 
 
255 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  33.94 
 
 
293 aa  99.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  33.47 
 
 
284 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  38.58 
 
 
245 aa  97.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  31.6 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  36.86 
 
 
244 aa  96.3  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  33.46 
 
 
255 aa  95.9  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2217  pantothenate kinase  32.06 
 
 
263 aa  95.5  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  33.07 
 
 
279 aa  94.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  32.96 
 
 
293 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  31.91 
 
 
262 aa  94  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  34.38 
 
 
265 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  34.38 
 
 
265 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  34.77 
 
 
262 aa  93.6  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  33.98 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  41.28 
 
 
262 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  39.41 
 
 
248 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  40.57 
 
 
259 aa  92  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  32.05 
 
 
270 aa  92  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  41.52 
 
 
262 aa  92  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  31.75 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.37 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  32.35 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  40.12 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  41.24 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  41.24 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  41.24 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  41.24 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  41.24 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  40.68 
 
 
256 aa  89.4  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  38.82 
 
 
249 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  31.27 
 
 
270 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  35.53 
 
 
277 aa  85.9  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  34.34 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  24.71 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  29.92 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  28.46 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  29.55 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1772  pantothenate kinase  25.4 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  32.99 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  35.48 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  35.48 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  34.56 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  28.97 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.09 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  33.8 
 
 
249 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  30.21 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  27.42 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  33.33 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.32 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.85 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  37.13 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  35.98 
 
 
249 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  39.09 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  39.09 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  34.21 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  25.68 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  30.56 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  36.27 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1367  pantothenate kinase  24.6 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  29.37 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  29.53 
 
 
245 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  27.78 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  27.89 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  31.68 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  28.97 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1518  pantothenate kinase  30.15 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  33.06 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0958  pantothenate kinase  31.86 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  29.65 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  30.12 
 
 
244 aa  72  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  25.79 
 
 
242 aa  72  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  28.57 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  33.55 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0578  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.93 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.13 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  27.71 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  33.33 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0294  pantothenate kinase  31.37 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.27 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0613  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.57 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0452  transcriptional activator, putative, Baf family  32.57 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0238  putative transcriptional acitvator, Baf family  24.43 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  32.49 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1093  putative transcriptional activator, Baf family  31.33 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.040353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>