228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0311 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  100 
 
 		 295 aa  579  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  79.93 
 
 		 293 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  78.98 
 
 		 293 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  52.69 
 
 		 277 aa  231  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  52.63 
 
 		 275 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  43.12 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  43.12 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  43.12 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  43.12 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  43.12 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  42.91 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  42.75 
 
 		 256 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  42.25 
 
 		 289 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  43.32 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  41.49 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  38.65 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  40.14 
 
 		 262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  40.43 
 
 		 262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  39.71 
 
 		 266 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  39.64 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  39.71 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  39.71 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  41.64 
 
 		 245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  36.82 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  37.91 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  35.87 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  35.87 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  36.59 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  35.51 
 
 		 238 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  33.1 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  36.13 
 
 		 254 aa  119  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  34.52 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  34.78 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  36 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  32.97 
 
 		 255 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  36.17 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  32.6 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  40.11 
 
 		 254 aa  99  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.64 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.41 
 
 		 255 aa  95.5  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 246 aa  94.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  33.94 
 
 		 248 aa  93.2  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  32.62 
 
 		 253 aa  93.2  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  36.3 
 
 		 256 aa  92.4  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  32.85 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  28.28 
 
 		 266 aa  91.3  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  29.21 
 
 		 248 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2217  pantothenate kinase  34.63 
 
 		 263 aa  89  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  27.66 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  27.11 
 
 		 244 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  27.66 
 
 		 249 aa  85.9  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  35.44 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  29.26 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  29.26 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  29.26 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0958  pantothenate kinase  31.29 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  30.83 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  32.79 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1765  pantothenate kinase  31.25 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  28.16 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  34.3 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  27.08 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  33.16 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  26.67 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  33.16 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  31.75 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0294  pantothenate kinase  30.88 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  25.75 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  29.24 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  29.24 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  30.99 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  28.78 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  30.1 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  42.5 
 
 		 256 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  42.5 
 
 		 256 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.69 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  26.79 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  28 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  26.42 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.1 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3997  Baf family transcriptional activator  28.49 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000868707  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  26.78 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  35.57 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  29.35 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.21 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1294  pantothenate kinase  28.44 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  29.35 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02843  pantothenate kinase  28.39 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1811  pantothenate kinase  32.53 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0578  putative transcriptional acitvator, Baf family  39.08 
 
 		 257 aa  72  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  29.65 
 
 		 263 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  30.23 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  29.41 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  30.45 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2285  pantothenate kinase  30.59 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  29.78 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  37.12 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  29.65 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2715  putative transcriptional activator, Baf family  32.56 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1480  pantothenate kinase  31.14 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0377381  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>