152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0916 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  521  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  33.08 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  30.98 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  33.47 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  29.73 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  32.37 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  32.83 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.53 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  30.29 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  29.28 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  28.69 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  29.81 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  30.98 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  35.24 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.74 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  32.35 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  27.54 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  30.13 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  27.97 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  33.54 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  28.75 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  31.07 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3997  Baf family transcriptional activator  32.87 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000868707  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  29.41 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  31.8 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  31.07 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  31.16 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.5 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  30.42 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  34.42 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  31.25 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  38.82 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  28.51 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  30.1 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  30.1 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  30.1 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  26.16 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  25.85 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  29.61 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  33.55 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  29.88 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  30.77 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  28.97 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  27.93 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.755587 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  27.93 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  27.93 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  36.99 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  29.72 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.11 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  26.57 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  31.17 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  28.64 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  28.64 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  29.73 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  33.97 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  28.36 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  29.61 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.67 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  31.61 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  31.61 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  31.61 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  31.61 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  31.61 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  26.36 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0146  pantothenate kinase  29.5 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2229  pantothenate kinase  26.34 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  26.75 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8379  pantothenate kinase  29.55 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  29.61 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  23.41 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  32.26 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  29.09 
 
 		 289 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  28.95 
 
 		 270 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  26.62 
 
 		 266 aa  52.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0993  pantothenate kinase  35.81 
 
 		 209 aa  52  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  28.29 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0327  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.73 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  26.97 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  30 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1868  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.44 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0248735  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  29.77 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  27.32 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02240  transcriptional activator, putative, Baf family  29.74 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  24.62 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  31.55 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  26.05 
 
 		 262 aa  50.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  31.55 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  26.12 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1801  pantothenate kinase  27.13 
 
 		 295 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3221  pantothenate kinase  26.32 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1294  pantothenate kinase  26.18 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0064  pantothenate kinase  25.76 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0065  pantothenate kinase  25.76 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0061  pantothenate kinase  25.76 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0061  pantothenate kinase  25.76 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0065  pantothenate kinase  25.76 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0077  pantothenate kinase  25.76 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.02884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0074  pantothenate kinase  25.76 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.335209 
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  29.56 
 
 		 244 aa  48.9  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>