77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0993 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0993  pantothenate kinase  100 
 
 
209 aa  424  1e-118  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0217  pantothenate kinase  77.03 
 
 
209 aa  347  9e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0585  transcriptional activator, Baf family  60.1 
 
 
207 aa  274  6e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0443  pantothenate kinase  55.29 
 
 
209 aa  260  1e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0676468  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0417  pantothenate kinase  55.29 
 
 
209 aa  260  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000353055  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1150  pantothenate kinase  56.25 
 
 
210 aa  259  2e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0493406  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0481  pantothenate kinase  57.21 
 
 
207 aa  258  6e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1564  pantothenate kinase  54.81 
 
 
209 aa  258  6e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1638  pantothenate kinase  52.2 
 
 
206 aa  226  1e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0888  pantothenate kinase  37.93 
 
 
205 aa  157  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.394748  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0188  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.57 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164212  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  35.59 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  33.55 
 
 
251 aa  62.8  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  28.23 
 
 
242 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  24.9 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1218  pantothenate kinase  27.82 
 
 
266 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0258135  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1367  pantothenate kinase  25.73 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  29.85 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  29.25 
 
 
252 aa  53.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  29.86 
 
 
249 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  38.04 
 
 
270 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.45 
 
 
269 aa  53.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  35.81 
 
 
260 aa  52.8  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  30.22 
 
 
251 aa  52.4  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  30.43 
 
 
279 aa  52  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  29.5 
 
 
246 aa  51.6  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00921  transcriptional regulator  29.8 
 
 
231 aa  52  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  29.85 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  26.38 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0613  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.35 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4170  pantothenate kinase  26.58 
 
 
241 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0452  transcriptional activator, putative, Baf family  26.35 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2997  pantothenate kinase  27.22 
 
 
258 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  24.63 
 
 
262 aa  50.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  30.83 
 
 
245 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  26.06 
 
 
255 aa  49.3  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  28.08 
 
 
248 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3123  pantothenate kinase  27.22 
 
 
258 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  29.17 
 
 
249 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00931  transcriptional regulator  27.81 
 
 
231 aa  48.9  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  30.53 
 
 
244 aa  48.9  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  24.34 
 
 
242 aa  48.9  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  27.78 
 
 
248 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  27.27 
 
 
255 aa  48.5  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  28.57 
 
 
254 aa  48.1  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1772  pantothenate kinase  32.52 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  23.89 
 
 
242 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0083  putative transcriptional acitvator, Baf  28.17 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  24.16 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3221  pantothenate kinase  28.06 
 
 
272 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.22 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  34.18 
 
 
284 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2217  pantothenate kinase  25 
 
 
263 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  30.53 
 
 
246 aa  45.4  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  29.6 
 
 
256 aa  45.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  28.36 
 
 
266 aa  45.4  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  33.33 
 
 
245 aa  45.1  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2715  putative transcriptional activator, Baf family  29.92 
 
 
255 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  26.14 
 
 
256 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  23.73 
 
 
254 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  24.72 
 
 
258 aa  44.3  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  24.72 
 
 
258 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  23.45 
 
 
256 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  29.17 
 
 
249 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1444  accessory factor Bvg  22.86 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.327883  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  40.24 
 
 
254 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4140  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.65 
 
 
255 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  31 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01451  transcriptional regulator  23.12 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0238  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.82 
 
 
260 aa  43.1  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.99 
 
 
249 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  29.17 
 
 
249 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1765  pantothenate kinase  27.74 
 
 
272 aa  42.4  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  26.67 
 
 
255 aa  42  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  25.17 
 
 
249 aa  42  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.56 
 
 
252 aa  41.6  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1868  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.15 
 
 
254 aa  41.2  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0248735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>