155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0385 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0385  putative transcriptional acitvator, Baf  100 
 
 		 252 aa  498  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.520442  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2308  putative transcriptional regulators  52.91 
 
 		 241 aa  208  8e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02601  transcriptional regulator  45.04 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00891  transcriptional regulator  40.53 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.529002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1444  accessory factor Bvg  33.04 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.327883  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01451  transcriptional regulator  32.59 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0083  putative transcriptional acitvator, Baf  32.89 
 
 		 227 aa  121  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00921  transcriptional regulator  33.78 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00931  transcriptional regulator  31.84 
 
 		 231 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00901  transcriptional regulator  32 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66751  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  32.67 
 
 		 247 aa  99  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4170  pantothenate kinase  31.39 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3123  pantothenate kinase  27.06 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1801  pantothenate kinase  29.75 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4022  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.94 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147612 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2997  pantothenate kinase  27.06 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1164  Baf family transcriptional activator  27.95 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  30.82 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  32.58 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  30.32 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00680  pantothenate kinase  28.22 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  30.32 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  30.32 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  22.71 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  29.23 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0136  pantothenate kinase  26.75 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000027573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  29.68 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1480  pantothenate kinase  29.03 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0377381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0613  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.8 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0452  transcriptional activator, putative, Baf family  32.8 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1331  pantothenate kinase  33.59 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181075  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  29.03 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  28.66 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  28.06 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.63 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  29.68 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  29.68 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  31.78 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  32.54 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3950  transcriptional activator, Baf family  32.7 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.151216  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  28.06 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  28.36 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2229  pantothenate kinase  30.77 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  30.6 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0061  pantothenate kinase  28.4 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  30.32 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0065  pantothenate kinase  29.01 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000107258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0160  pantothenate kinase  29.56 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144798  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  32.39 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  31.94 
 
 		 279 aa  52.8  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.85 
 
 		 254 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  28.85 
 
 		 258 aa  52.4  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4446  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.13 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  31.18 
 
 		 295 aa  52  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  28.37 
 
 		 244 aa  52.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  25.47 
 
 		 269 aa  52  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0064  pantothenate kinase  27.78 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0065  pantothenate kinase  27.78 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0061  pantothenate kinase  27.78 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0061  pantothenate kinase  27.78 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0065  pantothenate kinase  27.78 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0077  pantothenate kinase  27.78 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.02884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0063  pantothenate kinase  29.03 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  34.07 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  29.37 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1772  pantothenate kinase  25.81 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  25 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5243  pantothenate kinase  27.78 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.141011 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0074  pantothenate kinase  27.78 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.335209 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.39 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.99 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0762  pantothenate kinase  34.29 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  29.13 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0061  pantothenate kinase  28.4 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0073  pantothenate kinase  27.78 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  32.5 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1367  pantothenate kinase  24.69 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1868  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.57 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0248735  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  29.03 
 
 		 258 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  28.39 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  30.56 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  26.28 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  30.56 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  28.97 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1265  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.81 
 
 		 262 aa  49.3  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  34.38 
 
 		 248 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  24.11 
 
 		 243 aa  49.3  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1150  pantothenate kinase  27.4 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0493406  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  39.47 
 
 		 293 aa  48.9  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  27.85 
 
 		 256 aa  49.3  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  32.87 
 
 		 245 aa  48.9  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 255 aa  48.9  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0424  Baf family transcriptional activator  25.78 
 
 		 255 aa  48.9  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00396752  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0544  pantothenate kinase  28.03 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  25.6 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  23.46 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2784  pantothenate kinase  22.43 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2470  pantothenate kinase  22.43 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  31.36 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  29.63 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.755587 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>