82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_00891 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_00891  transcriptional regulator  100 
 
 
228 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.529002  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02601  transcriptional regulator  51.8 
 
 
251 aa  241  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01451  transcriptional regulator  48.4 
 
 
247 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1444  accessory factor Bvg  46.46 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.327883  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2308  putative transcriptional regulators  41.58 
 
 
241 aa  159  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00931  transcriptional regulator  39.63 
 
 
231 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0083  putative transcriptional acitvator, Baf  40.09 
 
 
227 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0385  putative transcriptional acitvator, Baf  39.21 
 
 
252 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.520442  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00901  transcriptional regulator  38.2 
 
 
226 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66751  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00921  transcriptional regulator  38.71 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4170  pantothenate kinase  33.18 
 
 
241 aa  78.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  27.13 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  28.97 
 
 
248 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1164  Baf family transcriptional activator  30.17 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4022  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.5 
 
 
264 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1801  pantothenate kinase  30.53 
 
 
295 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3123  pantothenate kinase  28.11 
 
 
258 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2997  pantothenate kinase  28.29 
 
 
258 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  29.22 
 
 
253 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  29.7 
 
 
244 aa  56.6  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  29.3 
 
 
256 aa  56.6  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  28.87 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  28.66 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1150  pantothenate kinase  28 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0493406  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  25.81 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  28.32 
 
 
244 aa  52.4  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  24.8 
 
 
254 aa  52.4  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  29.49 
 
 
251 aa  52.4  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  26.21 
 
 
240 aa  51.6  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  20.81 
 
 
264 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.25 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  28.86 
 
 
254 aa  49.7  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.1 
 
 
269 aa  50.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  30.97 
 
 
245 aa  50.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  23.6 
 
 
238 aa  48.9  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0327  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.95 
 
 
261 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0888  pantothenate kinase  23.28 
 
 
205 aa  48.5  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.394748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  25.48 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.09 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  27.66 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  25.77 
 
 
256 aa  47  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  28.37 
 
 
246 aa  47  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  31.91 
 
 
254 aa  46.6  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  26.06 
 
 
262 aa  46.2  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1296  Baf family transcriptional activator  23.71 
 
 
255 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.17 
 
 
268 aa  45.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  27.7 
 
 
244 aa  45.8  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  27.39 
 
 
248 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  23.57 
 
 
255 aa  45.1  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  28.48 
 
 
249 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0136  pantothenate kinase  25.64 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000027573  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  25.64 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  29.87 
 
 
246 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.62 
 
 
253 aa  45.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  25.67 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  25.67 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  25.67 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  27.18 
 
 
254 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  25.67 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  25.67 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  25.67 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2470  pantothenate kinase  26.42 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  28.05 
 
 
270 aa  43.5  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  24.52 
 
 
255 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2784  pantothenate kinase  26.42 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3272  pantothenate kinase  27.88 
 
 
235 aa  43.5  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0481  pantothenate kinase  22.76 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  27.85 
 
 
249 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  28.83 
 
 
255 aa  43.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  26.49 
 
 
245 aa  42.7  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  27.62 
 
 
255 aa  42.4  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  22.38 
 
 
254 aa  42  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  24.54 
 
 
253 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  24.03 
 
 
263 aa  42  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  23.11 
 
 
256 aa  42  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  29.11 
 
 
249 aa  42  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  27.95 
 
 
279 aa  42  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  26.92 
 
 
242 aa  41.6  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  26.92 
 
 
242 aa  42  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2186  Baf family transcriptional activator  23.71 
 
 
255 aa  42  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0160  pantothenate kinase  26.28 
 
 
258 aa  41.6  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144798  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  27.22 
 
 
249 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>