63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2308 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2308  putative transcriptional regulators  100 
 
 		 241 aa  478  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0385  putative transcriptional acitvator, Baf  52.91 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.520442  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02601  transcriptional regulator  51 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00891  transcriptional regulator  41.58 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.529002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01451  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1444  accessory factor Bvg  32.9 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.327883  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00931  transcriptional regulator  34.16 
 
 		 231 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00921  transcriptional regulator  35 
 
 		 231 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0083  putative transcriptional acitvator, Baf  33.5 
 
 		 227 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00901  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66751  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4170  pantothenate kinase  32.54 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3123  pantothenate kinase  29.44 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2997  pantothenate kinase  29.44 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  29.07 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4022  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.5 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1801  pantothenate kinase  30.29 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1164  Baf family transcriptional activator  26.84 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  32 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  30.25 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.69 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  33.96 
 
 		 262 aa  48.9  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  27.27 
 
 		 240 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  30.43 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  32.74 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  30.83 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  32.77 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  30.77 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  32.69 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  32.48 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  30.77 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  27.27 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.1 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  33.06 
 
 		 293 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  28.79 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  26.96 
 
 		 252 aa  46.2  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1022  putative transcriptional acitvator, Baf family  23.42 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  26.43 
 
 		 243 aa  45.8  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2715  putative transcriptional activator, Baf family  25.66 
 
 		 255 aa  45.4  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  25 
 
 		 256 aa  45.4  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  25 
 
 		 256 aa  45.4  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  30.3 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.755587 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  29.37 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  31.25 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0452  transcriptional activator, putative, Baf family  33.98 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  32.46 
 
 		 293 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0613  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.98 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1367  pantothenate kinase  22.5 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  37.66 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0569  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.01 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.156963  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  29.91 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2470  pantothenate kinase  24.55 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2784  pantothenate kinase  24.55 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  28.46 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  29.68 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2229  pantothenate kinase  30.43 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  39.24 
 
 		 295 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  28.79 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  27.27 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  28.79 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  27.97 
 
 		 254 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  27.97 
 
 		 254 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.21 
 
 		 252 aa  42  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1294  pantothenate kinase  28.66 
 
 		 261 aa  42  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>