124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1444 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1444  accessory factor Bvg  100 
 
 		 233 aa  477  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.327883  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01451  transcriptional regulator  96.57 
 
 		 247 aa  464  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02601  transcriptional regulator  41.85 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00891  transcriptional regulator  46.46 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.529002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00931  transcriptional regulator  42.48 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00901  transcriptional regulator  40.18 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66751  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0083  putative transcriptional acitvator, Baf  40.62 
 
 		 227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00921  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0385  putative transcriptional acitvator, Baf  32.59 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.520442  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2308  putative transcriptional regulators  32.9 
 
 		 241 aa  139  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  25.73 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1164  Baf family transcriptional activator  29.57 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1801  pantothenate kinase  31.87 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4170  pantothenate kinase  28.69 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4022  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.42 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147612 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3123  pantothenate kinase  28.4 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2997  pantothenate kinase  28.5 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  25.73 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  28.22 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0327  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.35 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  28.57 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  26.02 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  27.04 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  28.3 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0081  putative transcriptional acitvator, Baf family  22.73 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  28.39 
 
 		 253 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  29.53 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  24.78 
 
 		 284 aa  52.4  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.85 
 
 		 269 aa  52.4  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  26.88 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  24.71 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4379  pantothenate kinase  27.03 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.174078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  26.45 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8379  pantothenate kinase  25.9 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2784  pantothenate kinase  23.81 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2470  pantothenate kinase  23.81 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  27.95 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  29.14 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  28.03 
 
 		 274 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.71 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  28.4 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  26.45 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4483  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.3 
 
 		 262 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  24.82 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5362  pantothenate kinase  23.78 
 
 		 271 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331999  normal  0.0497904 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1868  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.79 
 
 		 254 aa  49.3  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0248735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  25.47 
 
 		 255 aa  48.9  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  23.12 
 
 		 254 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  25.93 
 
 		 255 aa  48.5  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2229  pantothenate kinase  26.47 
 
 		 259 aa  48.5  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  23.89 
 
 		 258 aa  48.5  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  23.89 
 
 		 258 aa  48.5  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  26.36 
 
 		 256 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  24.02 
 
 		 269 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00680  pantothenate kinase  26.16 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2882  pantothenate kinase  21.84 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0464  pantothenate kinase  23.95 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  26.23 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0569  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.79 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.156963  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  25.16 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  22.5 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  22.5 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  26.09 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1638  pantothenate kinase  26 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1296  Baf family transcriptional activator  26.71 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3611  Baf family transcriptional activator  24.05 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4983  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.41 
 
 		 260 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442209  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2186  Baf family transcriptional activator  25.95 
 
 		 255 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  24.22 
 
 		 254 aa  45.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  27.92 
 
 		 238 aa  45.8  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  23.48 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0160  pantothenate kinase  24.84 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144798  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0136  pantothenate kinase  24.54 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000027573  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 260 aa  45.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  24.78 
 
 		 254 aa  45.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3000  pantothenate kinase  25 
 
 		 260 aa  45.4  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  27.1 
 
 		 249 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1480  pantothenate kinase  28.89 
 
 		 254 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0377381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2285  pantothenate kinase  26.67 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  23.67 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  24.68 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4005  transcriptional activator, Baf family  23.47 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  25.95 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  25.71 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  26.09 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13632  pantothenate kinase  24.85 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.3574e-61  normal  0.0267284 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  25.97 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  25.32 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0613  putative transcriptional acitvator, Baf family  26 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0452  transcriptional activator, putative, Baf family  26 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  25 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  28.3 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0578  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.38 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  25 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  24.52 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  25.32 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  27.12 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  23.12 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>