79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1150 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1150  pantothenate kinase  100 
 
 
210 aa  434  1e-121  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0493406  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0217  pantothenate kinase  56.25 
 
 
209 aa  256  1e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0993  pantothenate kinase  55.77 
 
 
209 aa  249  2e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0585  transcriptional activator, Baf family  54.68 
 
 
207 aa  239  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0481  pantothenate kinase  54.9 
 
 
207 aa  239  2e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0443  pantothenate kinase  50.49 
 
 
209 aa  221  6e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0676468  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0417  pantothenate kinase  50.49 
 
 
209 aa  221  6e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000353055  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1564  pantothenate kinase  50 
 
 
209 aa  219  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1638  pantothenate kinase  50.75 
 
 
206 aa  211  3.9999999999999995e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0888  pantothenate kinase  39.9 
 
 
205 aa  141  8e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.394748  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0188  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.77 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164212  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  29.07 
 
 
249 aa  63.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  32.5 
 
 
242 aa  63.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  33.33 
 
 
279 aa  61.6  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  27.1 
 
 
244 aa  61.6  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0613  putative transcriptional acitvator, Baf family  34.29 
 
 
241 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0452  transcriptional activator, putative, Baf family  34.29 
 
 
241 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  31.43 
 
 
247 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  27.98 
 
 
243 aa  58.2  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.11 
 
 
269 aa  57.8  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1367  pantothenate kinase  25.73 
 
 
247 aa  57  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  22.63 
 
 
251 aa  57  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  30.67 
 
 
248 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  25.9 
 
 
246 aa  55.1  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1772  pantothenate kinase  31.52 
 
 
255 aa  54.3  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00891  transcriptional regulator  28 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.529002  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  25.76 
 
 
266 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3123  pantothenate kinase  30.41 
 
 
258 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  26.75 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  25.64 
 
 
270 aa  53.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  26.79 
 
 
244 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  30 
 
 
249 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  29.41 
 
 
252 aa  52.4  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  28.1 
 
 
256 aa  52  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4170  pantothenate kinase  29.55 
 
 
241 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2997  pantothenate kinase  30 
 
 
258 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  29.8 
 
 
244 aa  50.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  30.23 
 
 
248 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  26.07 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  25 
 
 
242 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  25 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1801  pantothenate kinase  33.62 
 
 
295 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1164  Baf family transcriptional activator  30.18 
 
 
270 aa  50.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2217  pantothenate kinase  26.67 
 
 
263 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1218  pantothenate kinase  27.27 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0258135  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  27.08 
 
 
245 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00921  transcriptional regulator  33.1 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  28.24 
 
 
246 aa  49.7  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  29.22 
 
 
249 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  29.63 
 
 
248 aa  47.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  29.13 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  28.38 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.38 
 
 
253 aa  47  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0238  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.34 
 
 
260 aa  46.6  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.07 
 
 
252 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  28.19 
 
 
268 aa  45.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0385  putative transcriptional acitvator, Baf  27.4 
 
 
252 aa  46.2  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.520442  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0958  pantothenate kinase  28.57 
 
 
260 aa  45.1  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1868  putative transcriptional acitvator, Baf family  35.25 
 
 
254 aa  45.1  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0248735  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  29.84 
 
 
244 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00931  transcriptional regulator  30.28 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0083  putative transcriptional acitvator, Baf  28.17 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  35.37 
 
 
254 aa  44.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  30.14 
 
 
248 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  26.34 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1765  pantothenate kinase  27.52 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1408  pantothenate kinase  26.76 
 
 
270 aa  43.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  30.99 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  29.61 
 
 
269 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3221  pantothenate kinase  26.8 
 
 
272 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  28.1 
 
 
249 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  28.1 
 
 
249 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  25.15 
 
 
254 aa  42.4  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.12 
 
 
249 aa  42.4  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  27.33 
 
 
249 aa  42  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  29.37 
 
 
253 aa  42  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  25.32 
 
 
254 aa  42  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  25.78 
 
 
240 aa  42  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1811  pantothenate kinase  29.67 
 
 
262 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>