More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3369 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  911    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  55.63 
 
 		 451 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  55.63 
 
 		 451 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  53.21 
 
 		 469 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  52.98 
 
 		 466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  52.19 
 
 		 464 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  51.03 
 
 		 440 aa  419  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  50.35 
 
 		 454 aa  398  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  49.31 
 
 		 446 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  47.24 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  50.59 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  44.67 
 
 		 455 aa  365  1e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  42.49 
 
 		 440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  39.86 
 
 		 440 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  42.33 
 
 		 440 aa  338  8e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  42.49 
 
 		 457 aa  313  5.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80246  mitochondrial chaperone  37.5 
 
 		 560 aa  280  5e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.763396  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  37.01 
 
 		 629 aa  261  1e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  34.98 
 
 		 767 aa  249  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9634  predicted protein  31.92 
 
 		 480 aa  219  7e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  30.06 
 
 		 468 aa  177  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  32.6 
 
 		 432 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1060  ABC transporter  28.74 
 
 		 495 aa  172  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1402  hypothetical protein  29.71 
 
 		 495 aa  172  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  32.37 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  31.66 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  31.52 
 
 		 455 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  33.78 
 
 		 543 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  30.25 
 
 		 448 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  34.09 
 
 		 440 aa  159  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  28.41 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  30.94 
 
 		 443 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  34.04 
 
 		 574 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  31.03 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  27.73 
 
 		 434 aa  157  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  31.84 
 
 		 445 aa  156  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  37.82 
 
 		 481 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  34.46 
 
 		 456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  31.68 
 
 		 453 aa  152  8e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1420  hypothetical protein  28.89 
 
 		 486 aa  152  8.999999999999999e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  29.38 
 
 		 448 aa  152  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  30.97 
 
 		 461 aa  150  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  28.67 
 
 		 448 aa  149  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  32.03 
 
 		 473 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  30.4 
 
 		 499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  33.65 
 
 		 462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 		 456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  30.21 
 
 		 453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  30.47 
 
 		 455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  34.4 
 
 		 447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  32.96 
 
 		 456 aa  146  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  32.26 
 
 		 453 aa  142  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  28.29 
 
 		 470 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  30.84 
 
 		 473 aa  140  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  33.33 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  30.53 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  29.17 
 
 		 485 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  29.56 
 
 		 436 aa  137  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  24.6 
 
 		 434 aa  136  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  25.34 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  31.19 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  31.55 
 
 		 476 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  29.51 
 
 		 475 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  31.29 
 
 		 483 aa  134  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.08 
 
 		 559 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  33.52 
 
 		 450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  29.01 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  24.82 
 
 		 433 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  33.46 
 
 		 565 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  30.23 
 
 		 452 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  28.95 
 
 		 454 aa  129  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  30.13 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  28.65 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  28.65 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  30.52 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  26.15 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  32.67 
 
 		 470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  28.37 
 
 		 445 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  24.37 
 
 		 438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  33.58 
 
 		 556 aa  127  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  31.11 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6435  ABC-1 domain protein  30.32 
 
 		 473 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  30.65 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.8 
 
 		 559 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.83 
 
 		 509 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  32.53 
 
 		 568 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  30.23 
 
 		 565 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  25.56 
 
 		 480 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  31.93 
 
 		 477 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  30.23 
 
 		 565 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  32.69 
 
 		 556 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  29.41 
 
 		 458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  24.35 
 
 		 558 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  27.1 
 
 		 582 aa  120  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4048  hypothetical protein  37.34 
 
 		 556 aa  120  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  32.76 
 
 		 557 aa  120  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  28.05 
 
 		 564 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3884  ABC-1 domain protein  27.24 
 
 		 556 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  25.51 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  27.97 
 
 		 558 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>