More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3445 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  100 
 
 		 450 aa  895    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  42.67 
 
 		 462 aa  333  3e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  38.27 
 
 		 481 aa  256  6e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  32.68 
 
 		 476 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  36.62 
 
 		 470 aa  183  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  33.11 
 
 		 473 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  32.97 
 
 		 454 aa  182  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  34.07 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  39.69 
 
 		 438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  33.5 
 
 		 440 aa  163  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  34.06 
 
 		 448 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  33.92 
 
 		 477 aa  162  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  34.71 
 
 		 499 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  31.91 
 
 		 443 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  34.47 
 
 		 543 aa  156  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  33.42 
 
 		 445 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  33.42 
 
 		 445 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  39.69 
 
 		 437 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  31.11 
 
 		 455 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  33.08 
 
 		 451 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  33.51 
 
 		 445 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  34.84 
 
 		 448 aa  151  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  30.79 
 
 		 447 aa  150  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  30.86 
 
 		 438 aa  150  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  31.42 
 
 		 445 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  39.16 
 
 		 436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1468  hypothetical protein  29.58 
 
 		 562 aa  146  8.000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.954776  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  39.54 
 
 		 574 aa  143  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  34.85 
 
 		 556 aa  143  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  33.02 
 
 		 483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  38.4 
 
 		 447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  32.01 
 
 		 552 aa  140  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  30.83 
 
 		 461 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  32.23 
 
 		 473 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3756  ABC-1 domain protein  34.82 
 
 		 563 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  31.22 
 
 		 457 aa  137  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  31.63 
 
 		 475 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  32.62 
 
 		 565 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  28.1 
 
 		 566 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  33.12 
 
 		 485 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35328  predicted protein  36.24 
 
 		 640 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.678268 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  30.82 
 
 		 564 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  34.63 
 
 		 445 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  34.24 
 
 		 445 aa  130  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  34.2 
 
 		 440 aa  130  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  31.28 
 
 		 455 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.6 
 
 		 559 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  34.56 
 
 		 549 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  31.39 
 
 		 469 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  28.23 
 
 		 563 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.34 
 
 		 559 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2382  ABC-1 domain protein  31.53 
 
 		 557 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.423464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  31.21 
 
 		 551 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  33.25 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  34.99 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  31.82 
 
 		 466 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  33.65 
 
 		 457 aa  127  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  36.22 
 
 		 470 aa  127  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3296  hypothetical protein  32.44 
 
 		 684 aa  127  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  33.33 
 
 		 560 aa  126  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  32.8 
 
 		 559 aa  126  8.000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  33 
 
 		 582 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  32.93 
 
 		 581 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  31.97 
 
 		 452 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  32.82 
 
 		 581 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  34.78 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  29.97 
 
 		 582 aa  124  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03381  ABC transporter substrate binding protein  31.83 
 
 		 574 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  30.13 
 
 		 440 aa  124  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18521  hypothetical protein  33.71 
 
 		 616 aa  124  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0520951  normal  0.0416558 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  31.06 
 
 		 458 aa  123  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2153  predicted protein  32.88 
 
 		 397 aa  123  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.104794 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  32.17 
 
 		 557 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1325  hypothetical protein  31.65 
 
 		 619 aa  123  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.128955  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  32.81 
 
 		 455 aa  123  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21981  hypothetical protein  31.65 
 
 		 619 aa  123  8e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.544475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  32.49 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  34.63 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4764  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.42 
 
 		 501 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1388  ABC-1 domain protein  32.99 
 
 		 523 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000327052  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  30.26 
 
 		 558 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  28.27 
 
 		 585 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.36 
 
 		 558 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.44 
 
 		 584 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  35.71 
 
 		 556 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19041  hypothetical protein  31.56 
 
 		 618 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0932  hypothetical protein  30.77 
 
 		 514 aa  121  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  31.52 
 
 		 568 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.77 
 
 		 559 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  34.44 
 
 		 557 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  32.67 
 
 		 558 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0375  ABC-1 domain protein  31.07 
 
 		 665 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0384  ABC-1 domain protein  31.07 
 
 		 665 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.283618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  34.19 
 
 		 619 aa  119  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19231  hypothetical protein  31.21 
 
 		 618 aa  119  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.494256  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19051  hypothetical protein  32.48 
 
 		 618 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  31.58 
 
 		 434 aa  119  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2782  ABC-1 domain protein  34.41 
 
 		 613 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95149  normal  0.892849 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  32.51 
 
 		 576 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  32.75 
 
 		 560 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>