More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1965 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  100 
 
 		 564 aa  1140    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6435  ABC-1 domain protein  35.06 
 
 		 473 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1468  hypothetical protein  31.63 
 
 		 562 aa  250  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.954776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0170  hypothetical protein  31.81 
 
 		 588 aa  251  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4587  hypothetical protein  31.88 
 
 		 610 aa  243  9e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0690861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  29.96 
 
 		 576 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4721  hypothetical protein  30.43 
 
 		 562 aa  231  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2782  ABC-1 domain protein  30.26 
 
 		 613 aa  224  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95149  normal  0.892849 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  30.54 
 
 		 561 aa  223  4.9999999999999996e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  32.11 
 
 		 585 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  31.87 
 
 		 578 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  29.35 
 
 		 563 aa  221  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  27.07 
 
 		 558 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.09 
 
 		 558 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  30.94 
 
 		 571 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  34.11 
 
 		 458 aa  210  6e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1310  ABC-1 domain protein  26.61 
 
 		 562 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1338  ABC-1 domain protein  26.61 
 
 		 562 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328718 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2052  ABC-1 domain protein  32.32 
 
 		 570 aa  208  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000299462 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2690  ABC-1 domain protein  30.06 
 
 		 582 aa  205  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.066858  normal  0.0662715 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  31.11 
 
 		 582 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  32.62 
 
 		 557 aa  201  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  26.88 
 
 		 558 aa  200  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  28.31 
 
 		 566 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02381  putative kinase  26.8 
 
 		 555 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.802769  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  27.46 
 
 		 584 aa  197  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.56 
 
 		 559 aa  196  9e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1617  ABC-1 domain protein  27.15 
 
 		 547 aa  196  9e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1576  putative kinase  26.37 
 
 		 559 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  27.27 
 
 		 561 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0211  putative kinase  27.69 
 
 		 555 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02851  putative kinase  26.9 
 
 		 541 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  27.72 
 
 		 557 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  29.92 
 
 		 552 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.64 
 
 		 557 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02271  putative kinase  27.62 
 
 		 555 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  31.57 
 
 		 557 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3884  ABC-1 domain protein  30.53 
 
 		 556 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  28.6 
 
 		 551 aa  191  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2382  ABC-1 domain protein  28.09 
 
 		 557 aa  190  7e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.423464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  26.1 
 
 		 558 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  30.46 
 
 		 552 aa  189  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  30.44 
 
 		 559 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  29.85 
 
 		 559 aa  189  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02291  putative kinase  27.53 
 
 		 555 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.79 
 
 		 554 aa  189  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0932  hypothetical protein  27.8 
 
 		 514 aa  188  3e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1043  hypothetical protein  26.23 
 
 		 559 aa  187  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135473  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  31.19 
 
 		 557 aa  188  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.83 
 
 		 573 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  27.7 
 
 		 556 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02281  putative kinase  26.47 
 
 		 560 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2256  ABC-1 domain protein  27.24 
 
 		 560 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398282 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  29.3 
 
 		 563 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.81 
 
 		 559 aa  183  9.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  31.4 
 
 		 568 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.12 
 
 		 553 aa  182  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  30.97 
 
 		 619 aa  182  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  28.72 
 
 		 565 aa  182  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  30.83 
 
 		 558 aa  181  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.02 
 
 		 559 aa  179  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39458  predicted protein  28.38 
 
 		 660 aa  179  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.297537 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  32.83 
 
 		 544 aa  179  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  30.66 
 
 		 558 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  26.31 
 
 		 561 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  30.24 
 
 		 560 aa  179  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27711  putative kinase  28.54 
 
 		 559 aa  177  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2068  ABC-1 domain protein  27.49 
 
 		 586 aa  177  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  24.47 
 
 		 561 aa  176  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  26.1 
 
 		 537 aa  176  8e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.3 
 
 		 553 aa  176  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  28.83 
 
 		 565 aa  176  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  28.83 
 
 		 565 aa  176  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  26.32 
 
 		 537 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1153  ABC-1 domain protein  29.89 
 
 		 511 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0129573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  24.42 
 
 		 561 aa  174  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  26.24 
 
 		 555 aa  174  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.36 
 
 		 561 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  31.99 
 
 		 550 aa  172  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5458  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.29 
 
 		 521 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  28.31 
 
 		 560 aa  172  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  25.83 
 
 		 560 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0434  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.29 
 
 		 525 aa  171  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  25.98 
 
 		 560 aa  170  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  29.09 
 
 		 557 aa  170  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  32.72 
 
 		 565 aa  170  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  27.25 
 
 		 564 aa  169  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.8 
 
 		 522 aa  169  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.33 
 
 		 592 aa  169  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  28.27 
 
 		 583 aa  169  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0374  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.25 
 
 		 525 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.218508 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.8 
 
 		 525 aa  168  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33 
 
 		 509 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.27 
 
 		 558 aa  169  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3641  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.42 
 
 		 522 aa  168  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.302348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  27.64 
 
 		 562 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.27 
 
 		 522 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.02 
 
 		 504 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  28.32 
 
 		 581 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0595  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.5 
 
 		 540 aa  167  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>