More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0409 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  100 
 
 
458 aa  932    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  34.57 
 
 
564 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  33.6 
 
 
557 aa  208  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  32.22 
 
 
576 aa  205  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  36.1 
 
 
557 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  33.95 
 
 
568 aa  200  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.73 
 
 
559 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  31.48 
 
 
563 aa  200  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1468  hypothetical protein  33.84 
 
 
562 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.954776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0170  hypothetical protein  33.33 
 
 
588 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  34.12 
 
 
549 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4587  hypothetical protein  32.03 
 
 
610 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0690861  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  32.27 
 
 
549 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  32.27 
 
 
549 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4721  hypothetical protein  34.64 
 
 
562 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  32.72 
 
 
547 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  31.87 
 
 
558 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  32.17 
 
 
557 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.9 
 
 
557 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  32.79 
 
 
551 aa  184  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  31.24 
 
 
559 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  31.9 
 
 
557 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  31.83 
 
 
547 aa  183  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  31.81 
 
 
565 aa  183  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  32.61 
 
 
558 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  35.47 
 
 
560 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.68 
 
 
559 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  29.09 
 
 
453 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  31.03 
 
 
549 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.54 
 
 
549 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  32.17 
 
 
559 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  32.56 
 
 
544 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  33.43 
 
 
558 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6435  ABC-1 domain protein  29.81 
 
 
473 aa  176  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 
556 aa  176  8e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  32.1 
 
 
666 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  34.36 
 
 
558 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  31.71 
 
 
557 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  30.81 
 
 
558 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  30.73 
 
 
562 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  35.06 
 
 
565 aa  174  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.84 
 
 
554 aa  173  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  32.03 
 
 
563 aa  173  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.34 
 
 
530 aa  172  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  32.32 
 
 
561 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.15 
 
 
561 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  31.13 
 
 
619 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  31.87 
 
 
585 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1379  kinase  32.57 
 
 
549 aa  171  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  31.3 
 
 
582 aa  171  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0708  hypothetical protein  31.46 
 
 
583 aa  169  7e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  30.37 
 
 
470 aa  169  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0841  ABC-1 domain-containing protein  34.41 
 
 
652 aa  169  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4100  ABC-1 domain-containing protein  32.8 
 
 
659 aa  169  9e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35328  predicted protein  31.38 
 
 
640 aa  168  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.678268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.49 
 
 
592 aa  168  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.34 
 
 
558 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  31.66 
 
 
452 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  31.23 
 
 
552 aa  168  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.75 
 
 
559 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  31.65 
 
 
565 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  31.65 
 
 
565 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  27.69 
 
 
560 aa  167  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  27.79 
 
 
461 aa  167  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  31.84 
 
 
561 aa  167  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3267  ABC-1 domain protein  30.42 
 
 
567 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2905  ABC-1 domain-containing protein  28.92 
 
 
574 aa  166  8e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_2246  predicted protein  37.3 
 
 
299 aa  166  9e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0990218  normal  0.121296 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.4 
 
 
559 aa  166  9e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0637  putative ubiquinone biosynthesis protein  29.52 
 
 
458 aa  165  1.0000000000000001e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0003  hypothetical protein  31.42 
 
 
423 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00161336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1497  ABC-1 domain protein  32.21 
 
 
689 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000360105  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13150  predicted protein  28.84 
 
 
517 aa  164  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  31.68 
 
 
561 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  27.75 
 
 
561 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  29.31 
 
 
453 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  32.58 
 
 
571 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1228  unusual protein kinase  30.93 
 
 
606 aa  164  3e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.99408  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2512  hypothetical protein  30 
 
 
569 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.32 
 
 
573 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  30 
 
 
560 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19231  hypothetical protein  28.69 
 
 
618 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.494256  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1806  putative protein kinase:ABC1 family  28.15 
 
 
618 aa  163  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.396979  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  31.41 
 
 
584 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3884  ABC-1 domain protein  30.61 
 
 
556 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  30.18 
 
 
560 aa  163  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19051  hypothetical protein  29.37 
 
 
618 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86278  predicted protein  33.9 
 
 
620 aa  162  8.000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  32.05 
 
 
599 aa  162  9e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19041  hypothetical protein  28.69 
 
 
618 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  30 
 
 
578 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2353  ABC-1 domain protein  30.25 
 
 
578 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02381  putative kinase  28.15 
 
 
555 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.802769  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1576  putative kinase  27.7 
 
 
559 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.1 
 
 
559 aa  161  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0318  hypothetical protein  29.61 
 
 
592 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0340511  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0384  ABC-1 domain protein  29.33 
 
 
665 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.283618  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0375  ABC-1 domain protein  29.33 
 
 
665 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18521  hypothetical protein  28.16 
 
 
616 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0520951  normal  0.0416558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  29.82 
 
 
455 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0310282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>