More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2053 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  938    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  65.8 
 
 		 470 aa  598  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  61.69 
 
 		 453 aa  568  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  62.97 
 
 		 455 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  63.19 
 
 		 453 aa  559  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  61.38 
 
 		 453 aa  555  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  62.81 
 
 		 456 aa  550  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  60.98 
 
 		 455 aa  548  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  62.58 
 
 		 456 aa  550  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  62.81 
 
 		 456 aa  550  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  61.2 
 
 		 456 aa  532  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  58.24 
 
 		 452 aa  525  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  54.46 
 
 		 452 aa  485  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  53.47 
 
 		 454 aa  461  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  34.47 
 
 		 462 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  30.02 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  28.26 
 
 		 473 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  29.25 
 
 		 434 aa  173  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  29 
 
 		 438 aa  173  5.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  35.37 
 
 		 448 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  35.09 
 
 		 436 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  28.12 
 
 		 458 aa  169  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  34.55 
 
 		 543 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  32.65 
 
 		 447 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  34.07 
 
 		 437 aa  167  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  35.93 
 
 		 443 aa  167  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  29.82 
 
 		 440 aa  166  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  34.75 
 
 		 438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  29.89 
 
 		 445 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  34.7 
 
 		 455 aa  163  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  34.82 
 
 		 448 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  32.64 
 
 		 574 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  34.36 
 
 		 499 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  27.03 
 
 		 440 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  36.12 
 
 		 440 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  34.77 
 
 		 451 aa  160  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  33.86 
 
 		 448 aa  160  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  32.27 
 
 		 454 aa  159  7e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  32.54 
 
 		 469 aa  160  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  28.64 
 
 		 432 aa  159  7e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  26.1 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  28.54 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  32.45 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  32.34 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  27.89 
 
 		 433 aa  157  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  27.88 
 
 		 446 aa  157  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  27.81 
 
 		 476 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  31.15 
 
 		 466 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  30.3 
 
 		 445 aa  153  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  30.14 
 
 		 477 aa  153  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  35.49 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  37.35 
 
 		 475 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  27.05 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  34.53 
 
 		 558 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  30.3 
 
 		 445 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  30.3 
 
 		 445 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  30.3 
 
 		 445 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  25.82 
 
 		 433 aa  150  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  35.77 
 
 		 483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  36.33 
 
 		 558 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  31.63 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  34.17 
 
 		 485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  31.85 
 
 		 457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  33.89 
 
 		 481 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  30.15 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  30.15 
 
 		 451 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  31.94 
 
 		 454 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  33.22 
 
 		 564 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  26.98 
 
 		 440 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  29.07 
 
 		 480 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  26.88 
 
 		 468 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  33.57 
 
 		 566 aa  144  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  25.3 
 
 		 434 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  25.71 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  28.81 
 
 		 576 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2690  ABC-1 domain protein  31.6 
 
 		 582 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.066858  normal  0.0662715 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  24.94 
 
 		 440 aa  140  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  30.27 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  33.07 
 
 		 470 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  29.73 
 
 		 454 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  30.15 
 
 		 464 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  33.08 
 
 		 583 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  35.45 
 
 		 450 aa  137  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.42 
 
 		 555 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13150  predicted protein  28.79 
 
 		 517 aa  133  6.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3101  ABC-1 domain protein  30.55 
 
 		 564 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  29.22 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  33.11 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2382  ABC-1 domain protein  31.49 
 
 		 557 aa  131  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.423464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.02 
 
 		 559 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0170  hypothetical protein  28.91 
 
 		 588 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  25.72 
 
 		 455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  30.58 
 
 		 599 aa  130  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  25.48 
 
 		 558 aa  130  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_2246  predicted protein  32.3 
 
 		 299 aa  129  8.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0990218  normal  0.121296 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  28.81 
 
 		 559 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.57 
 
 		 549 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4587  hypothetical protein  28.91 
 
 		 610 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0690861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1402  hypothetical protein  27.87 
 
 		 495 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18521  hypothetical protein  29.3 
 
 		 616 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0520951  normal  0.0416558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>