More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2961 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  100 
 
 
437 aa  876    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  76.96 
 
 
445 aa  709    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  67.44 
 
 
455 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  64.22 
 
 
574 aa  571  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  64.14 
 
 
543 aa  565  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  62.21 
 
 
451 aa  559  1e-158  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  57.4 
 
 
448 aa  531  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  58.26 
 
 
448 aa  529  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  57.27 
 
 
499 aa  518  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  59.16 
 
 
440 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  57.34 
 
 
436 aa  504  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  54.13 
 
 
443 aa  498  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  55.63 
 
 
448 aa  488  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  57.79 
 
 
445 aa  475  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  50.69 
 
 
438 aa  449  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  50.23 
 
 
438 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  49.06 
 
 
447 aa  420  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  48.17 
 
 
447 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  48.18 
 
 
445 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  48.41 
 
 
445 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  48.41 
 
 
445 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  46.91 
 
 
445 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  47.02 
 
 
445 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  35.99 
 
 
462 aa  242  9e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  32.62 
 
 
473 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  34.17 
 
 
477 aa  192  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 
454 aa  183  7e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  33.18 
 
 
476 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  33.5 
 
 
454 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  31.78 
 
 
469 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  34.84 
 
 
432 aa  171  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  33.25 
 
 
470 aa  170  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  34.47 
 
 
457 aa  170  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  34 
 
 
454 aa  169  8e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  32.1 
 
 
466 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  33.07 
 
 
451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  33.07 
 
 
451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  32.03 
 
 
457 aa  167  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  34.07 
 
 
461 aa  167  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  31.09 
 
 
767 aa  167  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  32.09 
 
 
481 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  32.22 
 
 
432 aa  164  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  34.82 
 
 
454 aa  163  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  32.51 
 
 
455 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  30.46 
 
 
434 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  33.24 
 
 
440 aa  160  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  35.94 
 
 
452 aa  160  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  34.6 
 
 
629 aa  159  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  32.37 
 
 
446 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  29.91 
 
 
453 aa  157  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  32.45 
 
 
464 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  30.86 
 
 
433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  29.07 
 
 
433 aa  156  8e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  26.71 
 
 
438 aa  155  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  32.46 
 
 
455 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  31.71 
 
 
453 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  39.69 
 
 
450 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  27.13 
 
 
440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  31.63 
 
 
458 aa  154  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  33.63 
 
 
452 aa  152  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  32.06 
 
 
441 aa  152  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  27.5 
 
 
434 aa  152  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  26.33 
 
 
433 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  29.82 
 
 
440 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  31.96 
 
 
440 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  36 
 
 
473 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3267  ABC-1 domain protein  31.65 
 
 
567 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  28.83 
 
 
440 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3115  ABC-1 domain protein  31.51 
 
 
572 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3005  ABC-1 domain protein  31.51 
 
 
572 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2353  ABC-1 domain protein  32.84 
 
 
578 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  34.29 
 
 
564 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  27.8 
 
 
455 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  29.29 
 
 
666 aa  147  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  33.92 
 
 
456 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.04 
 
 
559 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  33.01 
 
 
557 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  34.63 
 
 
470 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49684  predicted protein  33.54 
 
 
788 aa  145  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  34.91 
 
 
475 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.23 
 
 
555 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  33.68 
 
 
456 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  33.22 
 
 
453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.94 
 
 
504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  33.68 
 
 
456 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.07 
 
 
559 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  35.32 
 
 
619 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.89 
 
 
530 aa  140  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  30.05 
 
 
485 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  27.87 
 
 
440 aa  140  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  31.8 
 
 
480 aa  139  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3756  ABC-1 domain protein  36.06 
 
 
563 aa  138  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.77 
 
 
559 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  36.74 
 
 
552 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  32.22 
 
 
549 aa  136  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5111  hypothetical protein  32.91 
 
 
455 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35328  predicted protein  29.57 
 
 
640 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.678268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2681  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.98 
 
 
539 aa  134  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2905  ABC-1 domain-containing protein  29.71 
 
 
574 aa  134  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1241  hypothetical protein  30.94 
 
 
451 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.279292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>