More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4228 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  100 
 
 		 440 aa  875    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  67.29 
 
 		 448 aa  596  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  63.39 
 
 		 448 aa  579  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  63.04 
 
 		 499 aa  570  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  62.41 
 
 		 443 aa  565  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  66.13 
 
 		 543 aa  564  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  65.43 
 
 		 451 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  64.5 
 
 		 436 aa  561  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  63.11 
 
 		 574 aa  547  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  62.47 
 
 		 448 aa  542  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  59.16 
 
 		 437 aa  527  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  56.49 
 
 		 455 aa  510  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  56.94 
 
 		 445 aa  505  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  58.2 
 
 		 445 aa  473  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  53.85 
 
 		 438 aa  467  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  50.58 
 
 		 438 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  54.11 
 
 		 447 aa  442  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  51.16 
 
 		 447 aa  432  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  50.58 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  50.58 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  50.58 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  50.12 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  49.42 
 
 		 445 aa  423  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  38.24 
 
 		 462 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  35.07 
 
 		 476 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  33.63 
 
 		 473 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  34.45 
 
 		 454 aa  194  3e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  32.7 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  32.7 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  34.47 
 
 		 470 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  33.11 
 
 		 466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  34.29 
 
 		 477 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  33.79 
 
 		 469 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  35.84 
 
 		 481 aa  176  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  33.25 
 
 		 454 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  31.15 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  32.65 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  31.49 
 
 		 464 aa  170  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  34.69 
 
 		 432 aa  169  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  30.41 
 
 		 433 aa  169  9e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  32.51 
 
 		 450 aa  168  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  31 
 
 		 432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  30.34 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  36.12 
 
 		 461 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  31.25 
 
 		 454 aa  159  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  30.54 
 
 		 485 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  33.08 
 
 		 454 aa  157  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  33.81 
 
 		 440 aa  156  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  29.79 
 
 		 452 aa  156  7e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  31.51 
 
 		 455 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  35.92 
 
 		 483 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  34.83 
 
 		 629 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  35.9 
 
 		 473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  30.51 
 
 		 438 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49684  predicted protein  33.93 
 
 		 788 aa  153  7e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  31.27 
 
 		 441 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  33.16 
 
 		 457 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  28.76 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  32.15 
 
 		 440 aa  150  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  32.27 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  34.31 
 
 		 475 aa  147  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  30.27 
 
 		 453 aa  147  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  35.6 
 
 		 453 aa  147  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  30.43 
 
 		 470 aa  146  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  26.81 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  26.76 
 
 		 440 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3267  ABC-1 domain protein  30.94 
 
 		 567 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  30.28 
 
 		 455 aa  144  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  31.31 
 
 		 446 aa  143  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  33.01 
 
 		 557 aa  142  9e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  30.28 
 
 		 453 aa  141  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  31.99 
 
 		 441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  33.56 
 
 		 452 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86278  predicted protein  33.12 
 
 		 620 aa  140  6e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  28.73 
 
 		 455 aa  139  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  30.71 
 
 		 456 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35328  predicted protein  34.35 
 
 		 640 aa  139  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.678268 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.36 
 
 		 549 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  35.29 
 
 		 565 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  30.71 
 
 		 456 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  30.71 
 
 		 456 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  30.95 
 
 		 458 aa  138  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.15 
 
 		 555 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  29.47 
 
 		 564 aa  136  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  33.67 
 
 		 767 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3115  ABC-1 domain protein  27.95 
 
 		 572 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  33.01 
 
 		 558 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3005  ABC-1 domain protein  30.32 
 
 		 572 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2353  ABC-1 domain protein  29.9 
 
 		 578 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  29.15 
 
 		 433 aa  133  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  28.97 
 
 		 480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  32.78 
 
 		 619 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  29.75 
 
 		 434 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  28.72 
 
 		 558 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1043  hypothetical protein  29.51 
 
 		 559 aa  130  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135473  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  28.29 
 
 		 468 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.17 
 
 		 559 aa  130  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3756  ABC-1 domain protein  32.89 
 
 		 563 aa  129  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  32.61 
 
 		 559 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21981  hypothetical protein  28.61 
 
 		 619 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.544475  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>