More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3492 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  100 
 
 		 438 aa  895    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  65.98 
 
 		 438 aa  588  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  55.25 
 
 		 447 aa  510  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  56.85 
 
 		 445 aa  509  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  56.39 
 
 		 445 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  55.99 
 
 		 445 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  55.76 
 
 		 445 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  55.76 
 
 		 445 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  54.46 
 
 		 448 aa  485  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  52.74 
 
 		 436 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  50 
 
 		 443 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  50.8 
 
 		 455 aa  435  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  49.21 
 
 		 448 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  47.43 
 
 		 448 aa  433  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  49.08 
 
 		 451 aa  433  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  50.23 
 
 		 437 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  50.58 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  47.2 
 
 		 499 aa  428  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  49.89 
 
 		 445 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  49.43 
 
 		 543 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  47.62 
 
 		 574 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  43.72 
 
 		 447 aa  365  1e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  44.27 
 
 		 445 aa  349  5e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  32.19 
 
 		 462 aa  206  9e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  31.65 
 
 		 473 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  30.84 
 
 		 476 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  31.5 
 
 		 454 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  31.3 
 
 		 454 aa  169  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 		 470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  34.75 
 
 		 461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  34.67 
 
 		 452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  31.49 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  33.78 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  31.14 
 
 		 481 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  32.68 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  33.55 
 
 		 454 aa  154  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  32.91 
 
 		 433 aa  153  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  30.69 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  32.9 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  32.37 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  33.11 
 
 		 473 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  33.75 
 
 		 455 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  35.38 
 
 		 552 aa  150  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  32.85 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  33.86 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  33.11 
 
 		 470 aa  144  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  26.9 
 
 		 457 aa  144  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  28.87 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3267  ABC-1 domain protein  30.08 
 
 		 567 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.33 
 
 		 558 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  29.89 
 
 		 454 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  33.77 
 
 		 455 aa  141  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.2 
 
 		 559 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  31.56 
 
 		 453 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  33.85 
 
 		 556 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  31.46 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.09 
 
 		 559 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  27.19 
 
 		 432 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  28.18 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  28.12 
 
 		 558 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  32.59 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  31.46 
 
 		 440 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  29.68 
 
 		 441 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  33.98 
 
 		 578 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1499  hypothetical protein  32.43 
 
 		 540 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  35.06 
 
 		 629 aa  136  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3115  ABC-1 domain protein  29.82 
 
 		 572 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18521  hypothetical protein  28.5 
 
 		 616 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0520951  normal  0.0416558 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3005  ABC-1 domain protein  29.75 
 
 		 572 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  29.74 
 
 		 480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02281  putative kinase  27.68 
 
 		 560 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  27.6 
 
 		 564 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  28.64 
 
 		 440 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0708  hypothetical protein  30.48 
 
 		 583 aa  134  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  32.35 
 
 		 483 aa  134  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49684  predicted protein  33.9 
 
 		 788 aa  133  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  31.97 
 
 		 453 aa  133  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  34.06 
 
 		 557 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  24.83 
 
 		 433 aa  132  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  35.07 
 
 		 767 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35328  predicted protein  30 
 
 		 640 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.678268 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_1228  predicted protein  30.93 
 
 		 413 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0764116  normal  0.0236358 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  24.04 
 
 		 440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1497  ABC-1 domain protein  31.99 
 
 		 689 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000360105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4100  ABC-1 domain-containing protein  32.44 
 
 		 659 aa  131  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  33.2 
 
 		 558 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2512  hypothetical protein  30.87 
 
 		 569 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2353  ABC-1 domain protein  29.83 
 
 		 578 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19051  hypothetical protein  31.42 
 
 		 618 aa  130  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  34.4 
 
 		 456 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  31.44 
 
 		 666 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  33.11 
 
 		 485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1806  putative protein kinase:ABC1 family  27.85 
 
 		 618 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.396979  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11901  kinase  27.38 
 
 		 551 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.16095  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2905  ABC-1 domain-containing protein  30.46 
 
 		 574 aa  128  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13150  predicted protein  27.59 
 
 		 517 aa  128  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3680  ABC-1 domain protein  31.44 
 
 		 670 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  34.13 
 
 		 537 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  34.13 
 
 		 537 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86278  predicted protein  32.35 
 
 		 620 aa  127  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>