More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3042 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  100 
 
 		 438 aa  889    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  65.98 
 
 		 438 aa  588  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  58.49 
 
 		 436 aa  516  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  55.94 
 
 		 445 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  56.55 
 
 		 448 aa  502  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  56.39 
 
 		 445 aa  502  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  54.63 
 
 		 447 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  54.34 
 
 		 443 aa  493  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  55.35 
 
 		 445 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  55.12 
 
 		 445 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  55.12 
 
 		 445 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  52.55 
 
 		 448 aa  465  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  53.33 
 
 		 451 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  54.63 
 
 		 543 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  53.85 
 
 		 440 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  50.45 
 
 		 448 aa  450  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  50.69 
 
 		 437 aa  449  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  49.1 
 
 		 499 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  51.85 
 
 		 574 aa  437  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  50.23 
 
 		 445 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  50.93 
 
 		 455 aa  438  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  49.21 
 
 		 445 aa  405  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  46.74 
 
 		 447 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  36.41 
 
 		 462 aa  239  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  31.66 
 
 		 473 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  32.71 
 
 		 434 aa  183  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  33.86 
 
 		 481 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  33.86 
 
 		 470 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  30.02 
 
 		 461 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  29.18 
 
 		 457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  31.44 
 
 		 477 aa  173  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  30.54 
 
 		 476 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  31.97 
 
 		 455 aa  170  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  30.84 
 
 		 452 aa  170  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  32.25 
 
 		 450 aa  166  9e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  30.95 
 
 		 454 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  33.44 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  30.05 
 
 		 454 aa  161  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  30.28 
 
 		 485 aa  159  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  30 
 
 		 483 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  33.85 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  34.19 
 
 		 433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  30.45 
 
 		 440 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  30.12 
 
 		 452 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  28.32 
 
 		 564 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  28.87 
 
 		 457 aa  154  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  33.87 
 
 		 433 aa  153  5e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  29.86 
 
 		 469 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  30 
 
 		 455 aa  152  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  31.03 
 
 		 454 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  30.3 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  34.33 
 
 		 473 aa  152  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  36.4 
 
 		 552 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13150  predicted protein  30.67 
 
 		 517 aa  147  5e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  34.33 
 
 		 475 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  30.31 
 
 		 557 aa  146  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.75 
 
 		 559 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  28.04 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  28.15 
 
 		 440 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  28.41 
 
 		 453 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  31.79 
 
 		 562 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  28.38 
 
 		 464 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  28.57 
 
 		 440 aa  143  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.96 
 
 		 559 aa  143  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  29.1 
 
 		 466 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  31.12 
 
 		 629 aa  142  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  28.34 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  27.59 
 
 		 558 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49684  predicted protein  32.83 
 
 		 788 aa  140  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  26.98 
 
 		 558 aa  140  4.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  28.54 
 
 		 451 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  27.62 
 
 		 432 aa  140  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21981  hypothetical protein  28.12 
 
 		 619 aa  139  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.544475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.88 
 
 		 559 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  25.06 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  34.34 
 
 		 556 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1325  hypothetical protein  28.12 
 
 		 619 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.128955  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3267  ABC-1 domain protein  31.76 
 
 		 567 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  30.81 
 
 		 559 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1468  hypothetical protein  27.27 
 
 		 562 aa  137  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.954776  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18521  hypothetical protein  27.59 
 
 		 616 aa  136  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0520951  normal  0.0416558 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  32.38 
 
 		 619 aa  136  8e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  26.75 
 
 		 555 aa  136  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3005  ABC-1 domain protein  31.51 
 
 		 572 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  29.18 
 
 		 558 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  28.79 
 
 		 456 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3115  ABC-1 domain protein  31.51 
 
 		 572 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  27.68 
 
 		 537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86278  predicted protein  28.44 
 
 		 620 aa  134  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  29.82 
 
 		 446 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.56 
 
 		 558 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  33.46 
 
 		 552 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  29.56 
 
 		 453 aa  134  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  29.94 
 
 		 666 aa  134  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35349  predicted protein  30.24 
 
 		 475 aa  133  6.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0653065  normal  0.0253902 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3680  ABC-1 domain protein  32.27 
 
 		 670 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  28.1 
 
 		 440 aa  133  6.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2681  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.38 
 
 		 539 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35328  predicted protein  34.08 
 
 		 640 aa  132  7.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.678268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  29.74 
 
 		 456 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>