More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4382 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  100 
 
 
448 aa  892    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  66.74 
 
 
448 aa  619  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  67.19 
 
 
499 aa  615  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  67.73 
 
 
543 aa  586  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  67.29 
 
 
440 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  65.22 
 
 
574 aa  570  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  63.95 
 
 
451 aa  559  1e-158  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  57.4 
 
 
437 aa  531  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  59.4 
 
 
445 aa  530  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  57.89 
 
 
443 aa  526  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  57.67 
 
 
455 aa  524  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  58.26 
 
 
436 aa  514  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  56.09 
 
 
448 aa  503  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  56.18 
 
 
445 aa  473  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  52.55 
 
 
438 aa  465  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  49.21 
 
 
438 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  48.52 
 
 
447 aa  432  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  49.31 
 
 
445 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  49.31 
 
 
445 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  49.08 
 
 
445 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  48.31 
 
 
445 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  50.35 
 
 
447 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  47.61 
 
 
445 aa  413  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  36.45 
 
 
462 aa  257  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  36.03 
 
 
470 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  33.58 
 
 
454 aa  192  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  31.85 
 
 
473 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  34.95 
 
 
476 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  34.81 
 
 
481 aa  184  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  34.07 
 
 
450 aa  180  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  33.48 
 
 
434 aa  176  9e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  32.8 
 
 
454 aa  173  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  35.05 
 
 
461 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  30.63 
 
 
477 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  29.77 
 
 
452 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  32.81 
 
 
455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  28.7 
 
 
440 aa  167  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  31.21 
 
 
454 aa  163  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  30.59 
 
 
466 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  29.06 
 
 
452 aa  159  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  27.7 
 
 
438 aa  159  9e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  30.32 
 
 
441 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  32.57 
 
 
457 aa  158  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  30.52 
 
 
464 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  31.12 
 
 
440 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  30.73 
 
 
469 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  30.11 
 
 
629 aa  157  4e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  29.35 
 
 
432 aa  157  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  31.04 
 
 
767 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  29.22 
 
 
433 aa  156  7e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  29.43 
 
 
433 aa  155  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49684  predicted protein  34.15 
 
 
788 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  31.81 
 
 
470 aa  154  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  35.67 
 
 
453 aa  153  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  30.16 
 
 
451 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  30.16 
 
 
451 aa  153  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35328  predicted protein  36.56 
 
 
640 aa  152  8.999999999999999e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.678268 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  30.73 
 
 
457 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  27.55 
 
 
468 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  31.72 
 
 
558 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  27.05 
 
 
434 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  28.6 
 
 
453 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  28.57 
 
 
455 aa  150  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  28.57 
 
 
440 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  27.77 
 
 
433 aa  146  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  29.41 
 
 
564 aa  146  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  31.6 
 
 
480 aa  146  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  28.38 
 
 
432 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  30.18 
 
 
454 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  29.45 
 
 
473 aa  144  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  35.64 
 
 
619 aa  144  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  33.01 
 
 
557 aa  143  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  29.67 
 
 
485 aa  143  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  29.97 
 
 
456 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  33.23 
 
 
558 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1499  hypothetical protein  32.71 
 
 
540 aa  141  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  29.89 
 
 
455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02271  putative kinase  29.9 
 
 
555 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3267  ABC-1 domain protein  31.87 
 
 
567 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  28.54 
 
 
475 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  30.05 
 
 
446 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.94 
 
 
555 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  29.84 
 
 
456 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  27.11 
 
 
440 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13150  predicted protein  31.01 
 
 
517 aa  138  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  30.69 
 
 
558 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02381  putative kinase  27.24 
 
 
555 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.802769  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  29.84 
 
 
456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1468  hypothetical protein  30.52 
 
 
562 aa  137  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.954776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  36.84 
 
 
565 aa  137  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  35.56 
 
 
666 aa  136  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  30.67 
 
 
576 aa  136  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11901  kinase  32.08 
 
 
551 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.16095  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  31.72 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  32.49 
 
 
565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  26.59 
 
 
440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  32.49 
 
 
565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02291  putative kinase  29.26 
 
 
555 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11891  kinase  31.65 
 
 
509 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290587  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  28.72 
 
 
453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>